| 查看: 3793 | 回复: 0 | |||
[交流]
请教：如何从系统发育树中分析基因分化的时间先后
|
生物信息专业小白，只会用mega来做系统发育树。现在想分析一下一个物种内一个家族的基因的分化时间的先后，想看看哪个是较早分化出来的，哪个是较晚分化出来的。各基因相似度大于90%。现在比较烦的是在同一个分支上的基因到底应该如何判断分化时间的先后呢？附件中图一是方法，图二是显示各分歧点的展开值，图三上面应该显示的是替换率吧。用的氨基酸序列进行分析的。比如图二中的1和4；7和8以及9,20,24三者呢，谁先出现，谁后分化？是否跟上下排列顺序有关？哪种模式下计算出来的进化树可以直接用枝长来判断？另外不知道参数设置的是否合理。请老师们指教 图片1.JPG  图片2.jpg  图片3.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有219人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
-
RO4929097 解析：双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
-
分子量 1157 的 PROTAC 怎么配不析出：SGK3-PROTAC1 的溶解、分装与图谱复核
已经有0人回复
-
logP 6.1 的羧酸怎么配母液：GSK 650394 的溶解窗口与稀释顺序
已经有0人回复
-
从"水不溶"到 71 mg/mL：雷特格韦的 pH 依赖溶解与螯合色谱边界
已经有0人回复
-
133 Ų 的极性表面积，如何决定 TNG462 的母液配制与色谱条件
已经有0人回复
