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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 用lammps的语言建模，设置同样的参数，怎么原子数不一样
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tina张

新虫 (小有名气)

[求助] 用lammps的语言建模，设置同样的参数，怎么原子数不一样 已有2人参与

region                     below  block 0  60  0  60  0  1
lattice                    diamond  3.5667
create_atoms               2  region  below

region                     up  block 0  60  0  60  23 24
lattice                    diamond  3.5667
create_atoms               3  region  up
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不忘初心
1楼 2016-05-30 22:16:35
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

lx_PICO

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by tina张 at 2016-11-15 09:20:51
请问那你是怎么解决的，我觉得有时候盒子的正负也决定着，好奇怪啊！...

我在lattice语句里加了origin 0.01 0.01 0.01就行了
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

tina张
9楼2016-11-15 12:02:02
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普通回帖

huoyin1

新虫 (小有名气)
张亚楠？

发自小木虫Android客户端
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可下载各类疑难文献，文库资源，行业、国家标准，中外图书
2楼2016-05-30 23:17:32
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jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
tina张: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-11-14 10:02:39
看起来没什么问题，你定义的两个region大小是一样的。你试试在region那一行的最后加一下"units box"，看一下可不可以，默认的是lattice
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3楼2016-05-31 15:21:56
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lx_PICO

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
是不是盒子大小的问题？盒子的Z方向尺寸是多少？
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

tina张
4楼2016-06-01 09:18:51
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wangsoft

木虫 (正式写手)
原子数可以算出来，看哪种错了

发自小木虫Android客户端
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5楼2016-06-01 12:52:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tina张

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-06-01 09:18:51
是不是盒子大小的问题？盒子的Z方向尺寸是多少？

盒子的大小不一般是按照模型来设定，只要求比模型大即可么？
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不忘初心
6楼2016-11-14 21:46:37
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lx_PICO

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by tina张 at 2016-11-14 21:46:37
盒子的大小不一般是按照模型来设定，只要求比模型大即可么？...

一般来说是的，但我以前也出现过比如说盒子最大值是60，然后生成原子区域设成60后有一部分原子没显示的情况
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7楼2016-11-14 23:52:23
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tina张

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-11-14 23:52:23
一般来说是的，但我以前也出现过比如说盒子最大值是60，然后生成原子区域设成60后有一部分原子没显示的情况...

请问那你是怎么解决的，我觉得有时候盒子的正负也决定着，好奇怪啊！
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不忘初心
8楼2016-11-15 09:20:51
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tina张

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-11-15 12:02:02
我在lattice语句里加了origin 0.01 0.01 0.01就行了...

我的也解决了，实在太感谢了！！！
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不忘初心
10楼2016-11-16 09:15:30
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