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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 新属鉴定，建完系统发育树之后出现问题了，求助求助
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zdx0506

新虫 (初入文坛)

[求助] 新属鉴定，建完系统发育树之后出现问题了，求助求助 已有2人参与

得到了一株细菌，黄杆菌科的，在Ezbiocloud比对后，相似度最高的为92%，然后我就把黄杆菌科内与我这个菌相似度较高的每个属都找了几个细菌，用mega5.1构建了系统发育树。但是我的菌HQA918自己在一个分支，并且自展值很低，这个树隐去小于50%的，请问应该怎么办？？是我选择的标准菌株不对么？因为需要从建树结果 选取模式菌株进行新属的鉴定，小白一个，求各位 大神指教。跪求

新属鉴定，建完系统发育树之后出现问题了，求助求助
图片1.png
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1楼 2016-05-27 23:07:29
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)
呵呵

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6楼2016-06-17 23:56:29
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二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

赶紧送重测序，然后基于全基因组ANI以及构树来研究，你花太多时间在这个16S上面了。
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2楼2016-06-14 11:41:01
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-06-14 11:41:01
赶紧送重测序，然后基于全基因组ANI以及构树来研究，你花太多时间在这个16S上面了。

你是来推销业务的？

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3楼2016-06-14 13:10:11
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chinayanfei

木虫 (小有名气)
我们一般是把eztaxon里比对的结果全部下载下来（fasta格式）～然后在总得建树～之后总体看看～以后再此基础上删除不必要的序列！

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4楼2016-06-14 20:11:19
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