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新虫 (初入文坛)

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虫号: 2847509
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专业: 生物化学

[求助] 新属鉴定，建完系统发育树之后出现问题了，求助求助已有2人参与

得到了一株细菌，黄杆菌科的，在Ezbiocloud比对后，相似度最高的为92%，然后我就把黄杆菌科内与我这个菌相似度较高的每个属都找了几个细菌，用mega5.1构建了系统发育树。但是我的菌HQA918自己在一个分支，并且自展值很低，这个树隐去小于50%的，请问应该怎么办？？是我选择的标准菌株不对么？因为需要从建树结果选取模式菌株进行新属的鉴定，小白一个，求各位大神指教。跪求

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1楼 2016-05-27 23:07:29

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

二十一业

铜虫 (小有名气)

应助: 59 (初中生)
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红花: 13
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注册: 2015-04-15
专业: 病原微生物与感染研究与诊

【答案】应助回帖

引用回帖:

3楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2016-06-14 13:10:11
你是来推销业务的？
...

我是来解决问题的。

由于传统菌种鉴定“金标准”，DNA-DNA杂交实验，操作复杂，成本高，对操作要求很严格，所以不利于菌种分类鉴定的发展。
基因组时代，菌种鉴定新“金标准”，文献如下：
Michael R, Ramon R M. Shifting the genomic gold standard for the prokaryotic species definition.[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2009, 106(45):19126-31.