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旭日and东升

新虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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帖子: 59
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虫号: 1453617
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专业: 生物信息学

[求助] 单细胞转录组测序已有1人参与

一组单细胞转录组测序结果，数据量没有问题，比对率在80%以上，但有reads覆盖的转录本只有3000多个，有的转录本覆盖reads几十万，这是什么原因啊
为什么覆盖的转录本这么少，是测序的原因还是样本污染了呢？

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1楼 2016-05-27 10:05:14

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wxf8470

木虫 (小有名气)

应助: 15 (小学生)
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专业: 神经生物学

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

如果测序时放在同一lane上，这种情况主要是样品本身的质量造成的。那个样品的RNA可能降解的比较厉害。

2楼2016-05-28 03:10:00

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