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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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Masterarbeit

新虫 (初入文坛)

[求助] md分子模拟 简化单位问题 已有2人参与

硕士毕业论文用mathematica自己编程进行md对金刚石分子模拟。使用了tersoff势函数。程序写了大部分了，现在需要化简单位。查了很多资料基本上都是讲了lj势能的单位化简。请问tersoff怎么简化单位以便计算。
还有tersoff对金刚石的势能参数在哪里能查到呢？我找了几篇论文看到了一个简单的参数表但是教授说不对。有没有具体的书籍能够查阅？
本人机械专业却选到了这么一个题目。希望研究分子模拟的大师们能多多指导。

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1楼 2016-05-27 03:48:24
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abinitio

版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Masterarbeit at 2016-05-28 14:20:50
ab initio 你好。我碰到一个问题想问问你的想法。
又找过一次教授。对于单位简化的问题估计他也没什么头绪。然后他让我用如你名字一样的ab initio计算。我之前三个月都在软件和精典力学的方法中寻求思路并且程序完 ...

同意@brucefan 的观点。
你的问题，基础上是在经典动力学能解决的范围之内，应该是没有必要用第一性原理进行计算。
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7楼2016-05-30 10:42:38
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1. Cheong, W. & Zhang, L. Molecular dynamics simulation of phase transformations in silicon monocrystals due to nano-indentation. Nanotechnology 11, 173–180 (2000).
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2楼2016-05-27 08:38:48
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Masterarbeit

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2016-05-27 08:38:48
1. Cheong, W. & Zhang, L. Molecular dynamics simulation of phase transformations in silicon monocrystals due to nano-indentation. Nanotechnology 11, 173–180 (2000).

abinition 你好。很感谢你每次有问题都你都热心的回复。

这个文档我之前找到过。我在编程过程中也使用的这个数据，但是教授说这个c在tersoff中的势能参数只适用于石墨结构，而金刚石的势能参数并不是这个。但是我查到的统统都是这个数据。

然后这篇论文中并没有讲到计算过程中单位的处理。因为原子物理量的数量级小，计算误差大，需要简化单位便于计算。然而长度 时间 力 温度 能量的单位应该如何统一。
在lj中有一个表格来计算。请问在tersoff中有没有类似的单位化简方法。

期待你的回复。谢谢。
md分子模拟 简化单位问题
捕获.PNG


md分子模拟 简化单位问题-1
捕获1.PNG
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3楼2016-05-27 14:18:20
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abinitio

版主 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Masterarbeit at 2016-05-27 14:18:20
abinition 你好。很感谢你每次有问题都你都热心的回复。

这个文档我之前找到过。我在编程过程中也使用的这个数据，但是教授说这个c在tersoff中的势能参数只适用于石墨结构，而金刚石的势能参数并不是这个。但是 ...

我觉得这个势函数不应该仅针对于石墨结构，金刚石结构也同样适用。如果有异议，可以用金刚石结构跑下看看是否稳定，或看看晶格参数。我感觉应该没问题。至于单位简化，我没用过，不了解。

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Masterarbeit
4楼2016-05-27 15:35:44
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