| 查看: 940 | 回复: 11 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
liuds7792金虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】单机多核并行
|
||
|
我们有一台2cpu，每cpu 有 4个核的机器，想将这8个核并行起来运行vasp。 求高手给个办法。 [search]多核并行[/search] [ Last edited by wuchenwf on 2009-6-23 at 20:10 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
博士读完未来一定会好吗
已经有21人回复
-
导师想让我从独立一作变成了共一第一
已经有5人回复
-
到新单位后，换了新的研究方向，没有团队，持续积累2区以上论文，能申请到面上吗
已经有11人回复
-
读博
已经有4人回复
-
JMPT 期刊投稿流程
已经有4人回复
-
心脉受损
已经有5人回复
-
Springer期刊投稿求助
已经有4人回复
-
小论文投稿
已经有3人回复
-
Bioresource Technology期刊，第一次返修的时候被退回好几次了
已经有9人回复
-
申请2026年博士
已经有6人回复
quantum999
金虫 (著名写手)
- 应助: 15 (小学生)
- 金币: 2146.3
- 散金: 39
- 帖子: 1426
- 在线: 198.2小时
- 虫号: 41283
- 注册: 2004-03-05
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2008-11-01 19:49:13
liuds7792
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1007.5
- 散金: 58
- 帖子: 213
- 在线: 58.6小时
- 虫号: 164900
- 注册: 2006-01-12
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
3楼2008-11-01 20:20:09
liuds7792
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1007.5
- 散金: 58
- 帖子: 213
- 在线: 58.6小时
- 虫号: 164900
- 注册: 2006-01-12
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
|
VASP with OpenMP and MPI Moderators: admin. Author Post pavel Thu Oct 02 2008, 03:30PM Registered Member #923 Joined Tue Oct 17 2006, 04:08PM Location: Karlsruhe, Germany posts 15 Is it possible to compile VASP with combination of OpenMP (shared memory) within one node and MPI for communication between different nodes? It would be very useful for e.g. IBM Power 6 computers with 32 CPU per nodes. Has anyone an experience? Back to top job Mon Oct 06 2008, 03:17PM Registered Member #371 Joined: Tue Aug 16 2005, 09:44AM posts 44 Do you see any OpenMP directives in the source code? No? Well, that answers it then..  上面是vasp官方论坛的帖子，貌似说明vasp无法实现节点内并行，因为vasp源代码中没有OpenMP的指令 请高手明示！！ 谢谢 vasp官方贴链接： http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp-forum/forum_viewtopic.php?2.4851 |
4楼2008-11-01 20:56:17
quantum999
金虫 (著名写手)
- 应助: 15 (小学生)
- 金币: 2146.3
- 散金: 39
- 帖子: 1426
- 在线: 198.2小时
- 虫号: 41283
- 注册: 2004-03-05
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
5楼2008-11-02 09:06:15
liuds7792
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1007.5
- 散金: 58
- 帖子: 213
- 在线: 58.6小时
- 虫号: 164900
- 注册: 2006-01-12
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
|
输入：mpirun -np 2 ./vasp > out& 报错： mpiexec_xeon (handle_stdin_input 1089): stdin problem; if pgm is run in background, redirect from /dev/null mpiexec_xeon (handle_stdin_input 1090): e.g.: mpiexec -n 4 a.out < /dev/null & mpiexec_xeon (handle_stdin_input 1089): stdin problem; if pgm is run in background, redirect from /dev/null mpiexec_xeon (handle_stdin_input 1090): e.g.: mpiexec -n 4 a.out < /dev/null & |
6楼2008-11-02 12:33:57
liuds7792
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1007.5
- 散金: 58
- 帖子: 213
- 在线: 58.6小时
- 虫号: 164900
- 注册: 2006-01-12
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
7楼2008-11-02 19:17:45
liuds7792
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1007.5
- 散金: 58
- 帖子: 213
- 在线: 58.6小时
- 虫号: 164900
- 注册: 2006-01-12
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
★ ★ ★
wuli8(金币+3,VIP+0):感谢讨论，(*^__^*) …… 4-25 20:20
wuli8(金币+3,VIP+0):感谢讨论，(*^__^*) …… 4-25 20:20
|
终于搞定了，原来是libgoto的线程编译问题 http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp-forum/forum_viewtopic.php?2.4554 |
8楼2008-11-03 19:44:32
zhangyunli
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 贵宾: 0.06
- 金币: 1704.1
- 散金: 50
- 红花: 2
- 帖子: 413
- 在线: 116.9小时
- 虫号: 574740
- 注册: 2008-06-16
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
9楼2009-04-25 18:51:13
hakuna
木虫 (知名作家)
- 1ST强帖: 3
- 应助: 82 (初中生)
- 金币: 8735.9
- 散金: 158
- 红花: 126
- 帖子: 5599
- 在线: 1367.2小时
- 虫号: 167622
- 注册: 2006-01-15
- 专业: 考古理论
10楼2009-04-25 19:11:54