| 查看: 1623 | 回复: 4 | ||
[求助]
高通量测序建库时的标记引物选择 已有1人参与
|
|
求助：建Illumina的测序库，需要用index primer扩增后pool， 这是老外发给我的： IMPORTANT!!! Remember to choose your indexes wisely, they need a minimum of 3 Bp distance and also have a balanced relation between red/green laser activation see excel sheet with index primers. Index sequence capture 1 CGTAGT C G T A G T Capture 2 CAGCAC C A G C A C capture 3 ACTGCG A C T G C G capture 4 TCGATG T C G A T G capture 5 TACGAG T A C G A G capture 6 GTCGTC G T C G T C 这里的red是c和a，green是t和g。 问题是： 1. 3bp distance 指的是什么? index之间需要有最少3个序列不同吗? 那不是应该在设计引物的时候就设计好了. 2. 保持balanced relation 是指如果选择了上述的6个引物，那么我需要保证其总的ca/tg比例大约为1:1吗? 3.另外，Enter the total number of lanes you want to be processed. Examples: If you have one pool to be sequenced on 4 lanes, write “4”. If you have 4 pools to be sequenced on one lane each, write “4” If you have 2 pools to be sequenced on 2 lanes each, write “4”, but specify in the additional information field what you exactly need. 这里的lane指的是什么？ 分子基础比较薄弱，谢谢大家，祝实验顺利！ |
回复此楼» 猜你喜欢
生物质超级电容器
已经有0人回复
-
ALK5 高选择性小分子 LY-3200882：可放大合成路线与质控要点解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有104人回复
-
AM630（CAS 164178-33-0）：CB2 选择性配体的实验使用与供应要点
已经有0人回复
-
ADC标杆分子T-DM1全解析：从结构设计到实验室应用的技术要点
已经有0人回复
-
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做？
已经有0人回复
-
His标签蛋白纯化怎么才能快？
已经有0人回复
-
WRN变构抑制剂HRO761：从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析
已经有0人回复
-
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127：从三元复合物机制到科研应用
已经有0人回复
-
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib：从作用机制到科研试剂选型要点
已经有0人回复
-
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
joeming123
银虫 (小有名气)
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 209
- 红花: 1
- 帖子: 118
- 在线: 106.4小时
- 虫号: 3881007
- 注册: 2015-05-20
- 性别: GG
- 专业: 系统生物学
2楼2016-05-24 08:47:39
3楼2016-05-24 18:16:51
joeming123
银虫 (小有名气)
- 应助: 17 (小学生)
- 金币: 209
- 红花: 1
- 帖子: 118
- 在线: 106.4小时
- 虫号: 3881007
- 注册: 2015-05-20
- 性别: GG
- 专业: 系统生物学
4楼2016-05-25 10:30:08
5楼2016-05-25 18:17:25