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zfy535251

新虫 (小有名气)

[求助] 初学者~怎么研究一个蛋白活性的变化

最近发现一个基因外显子有突变,导致有一个氨基酸发生改变,我想问一下,接下来如果想要确定这个基因是不是我的目的基因,那我是不是要先看一下这个蛋白活性的变化?如果是,我需要做什么实验来研究?从来没接触过蛋白,望指导。如果可以,步骤越详细越好,谢谢各位啦

@gyesang 发自小木虫Android客户端
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丘皮特

新虫 (初入文坛)


如果想看一下是不是这个基因调控了蛋白,可以做个基因缺陷的对照,然后做个跑胶实验看下,如果想研究的更具体一些的话可以做几组对照实验,构建基因缺陷型的样本,和正常组做对照,先去做个基因测序,然后做个蛋白的全谱检测,找出差异蛋白和差异基因,做个关联分析。。

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2楼2016-05-22 13:18:08
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zfy535251

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 丘皮特 at 2016-05-22 13:18:08
如果想看一下是不是这个基因调控了蛋白,可以做个基因缺陷的对照,然后做个跑胶实验看下,如果想研究的更具体一些的话可以做几组对照实验,构建基因缺陷型的样本,和正常组做对照,先去做个基因测序,然后做个蛋白的 ...

我不是想看是不是这个基因调控了这个蛋白,可能我表达的不是很清楚,是这样的,我要找改变性状的目的基因,现在找到了一个基因的外显子发生了突变,翻译成氨基酸序列以后发现有一个氨基酸发生了改变,我想知道接下来怎么做?是不是要先看一下这个蛋白在野生和突变了有没有表达?如果都有表达,再对野生和突变里的这个蛋白进行活性分析?

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3楼2016-05-22 13:45:28
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璧月

捐助贵宾 (正式写手)

有很多方向可以选吧!酶,酶促反应。楼上提的构建基因缺陷样本,看生理生化变化。要看活性就要看蛋白的功能了,每个蛋白功能都不一样的。还有一种方式,序列分析,比方说脯氨酸的位置对二级结构影响比较大。

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4楼2016-05-23 15:41:46
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zfy535251

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 璧月 at 2016-05-23 15:41:46
有很多方向可以选吧!酶,酶促反应。楼上提的构建基因缺陷样本,看生理生化变化。要看活性就要看蛋白的功能了,每个蛋白功能都不一样的。还有一种方式,序列分析,比方说脯氨酸的位置对二级结构影响比较大。
...

怎么样构建基因缺陷样本呢

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5楼2016-05-24 16:00:19
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璧月

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zfy535251 at 2016-05-24 16:00:19
怎么样构建基因缺陷样本呢
...

我不是做分子的,楼上应该对这方面更清楚。

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6楼2016-05-25 05:35:50
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zfy535251

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 璧月 at 2016-05-25 05:35:50
我不是做分子的,楼上应该对这方面更清楚。
...

噢噢噢,谢谢啦

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7楼2016-05-25 07:53:13
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璧月

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by zfy535251 at 2016-05-25 07:53:13
噢噢噢,谢谢啦
...

可以先用软件对蛋白序列进行分析,预测一下结构,我也在摸索,用的dnastar里面的protean。

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8楼2016-05-25 11:38:25
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zfy535251

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 璧月 at 2016-05-25 11:38:25
可以先用软件对蛋白序列进行分析,预测一下结构,我也在摸索,用的dnastar里面的protean。
...

我这几天也在摸索这个软件,不过我只学会了第一步,不知道这个能不能出三级结构,也不知道这个软件能不能比对,继续努力中,不过我这个是有一个T变成了A

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9楼2016-05-25 14:50:01
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