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SNP calling 求助
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请问有经验的前辈，拼接完成的参考基因组如果有问题，会对突变株的SNP calling 有很大影响吗？用samtool call出来的SNP太多了，过滤完之后还是好多。文献中报道的关于抗噬菌体的突变株的SNP只有100多个。而我做出来的却有1000个左右。心累啊。。。而且这些SNP在质粒上有700个左右。 发自小木虫Android客户端 |
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