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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 关于lammps中special_bonds命令有点问题，请大神解答
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vip璋冩�?

银虫 (初入文坛)

[求助] 关于lammps中special_bonds命令有点问题，请大神解答 已有2人参与

假如我把special_bonds中得系数设为0.0，意思是不是成键的原子之间的pair势就关闭了，而不成键的原子之间的pair势还存在，这样理解对吗？
还有库仑力是不是也是这样的？（比如水分子，一个水分子中的O和H之间的pair或库伦力关闭了，而两个水分子之间O和O的pair或库仑力不变，是这样吗？）
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1楼 2016-05-09 17:02:22
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alundilong

木虫 (正式写手)

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感谢参与，应助指数 +1
的确是这样的！
The rationale for using these weighting factors is that the interaction between a pair of bonded atoms is all (or mostly) specified by the bond, angle, dihedral potentials, and thus the non-bonded Lennard-Jones or Coulombic interaction between the pair of atoms should be excluded (or reduced by a weighting factor).

“成键”的两个原子之间的作用是有“键”来确定，所以这两个原子之间的对势就得去除或者做相应的缩放。

成角，成二面角。。都是一个道理。
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2楼2016-05-10 00:13:55
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
首先 special——bonds 应该是用计算分子内非键结相互作用的，special_bonds  是一个分子上对于3个键或以上，才可以用，如 special——bonds lj 0.0 0.0 1.0
分别表示的 是 1-2 ，1-3 ，1-4原子 的lj 相互作用系数 ，分子内lj相互作用 ，如上例，1-2 1-3 是没有分子内lj 相互作用，但是 1-4 有lj 相互作用，有的设置为0.5 就是把1-4 原子间的lj相互作用乘以0.5
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每个人只能陪你走一段路程
3楼2016-05-10 15:57:57
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