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vip璋冩�?

银虫 (初入文坛)

[求助] 关于lammps中special_bonds命令有点问题,请大神解答 已有2人参与

假如我把special_bonds中得系数设为0.0,意思是不是成键的原子之间的pair势就关闭了,而不成键的原子之间的pair势还存在,这样理解对吗?
还有库仑力是不是也是这样的?(比如水分子,一个水分子中的O和H之间的pair或库伦力关闭了,而两个水分子之间O和O的pair或库仑力不变,是这样吗?)
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alundilong

木虫 (正式写手)

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的确是这样的!
The rationale for using these weighting factors is that the interaction between a pair of bonded atoms is all (or mostly) specified by the bond, angle, dihedral potentials, and thus the non-bonded Lennard-Jones or Coulombic interaction between the pair of atoms should be excluded (or reduced by a weighting factor).

“成键”的两个原子之间的作用是有“键”来确定,所以这两个原子之间的对势就得去除或者做相应的缩放。

成角,成二面角。。都是一个道理。
2楼2016-05-10 00:13:55
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)

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感谢参与,应助指数 +1
首先 special——bonds 应该是用计算分子内非键结相互作用的,special_bonds  是一个分子上对于3个键或以上,才可以用,如 special——bonds lj 0.0 0.0 1.0
分别表示的 是 1-2 ,1-3 ,1-4原子 的lj 相互作用系数 ,分子内lj相互作用 ,如上例,1-2 1-3 是没有分子内lj 相互作用,但是 1-4 有lj 相互作用,有的设置为0.5 就是把1-4 原子间的lj相互作用乘以0.5
每个人只能陪你走一段路程
3楼2016-05-10 15:57:57
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