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tttl060

金虫 (著名写手)


[交流] 【求助】dynamics运行失败

求助:半导体氧化物和水的作用动力学模拟,系综NVE,NOSE控温。。模拟到十几万步的时候,出现能量不收敛的情况,能量变化超过设定值5000。。。应该如何解决?你的建议会帮我解决掉这个问题!谢谢!
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头头

木虫 (正式写手)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
能量变化超过设定值500000 尝试一下,
…spendmoretimewithyourfamilyandfriends……eatyourfavoritefoods……visittheplacesyoulove…
5楼2008-10-29 23:22:32
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tttl060

金虫 (著名写手)


如题

不收敛的图像。。
2楼2008-10-29 18:43:01
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tttl060

金虫 (著名写手)


如题

模拟的图形如上。。
redream,谢谢你的纠正。。。系综是NVT....
请大家分析分析是什么原因。。。提示错误如下:
Energy: Nonbond group size check failed for: group: 270, atom: 811, dist: 6.496885
The group is too large. Repeat the calculation with smaller nonbond groups or a larger cutoff
Similar warning messages will not be output again
Energy: encountered 940 warnings
NOTE: Pressure and energy tail corrections will be added to all subsequent energy evaluations
3楼2008-10-29 18:47:21
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tttl060

金虫 (著名写手)


如题

切面深度16.0,cutoff=12.5
charge group 具体该如何设定,请指点。。。比如一个水分子,我是这样设定的:一个氧为一组,两个氢原子为另一组。
对于半导体,同类型的原子为一个组。。。
4楼2008-10-29 18:48:35
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