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uuu555000

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[交流] 78个菌的4个基因联合建树,可以用MEGA建系统发育树吗?

78个菌的4个基因联合建树,可以用MEGA,建系统发育树吗?
若用MEGA建的系统发育树可以用于发文章吗?
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无所谓好或不好,人生一场虚空大梦,韶华白首,不过转瞬,惟有天道恒在,往复循环,不曾更改
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stone2239

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uuu555000: 金币+2 2016-05-04 13:38:37
多基因串联建树可以用MEGA法,
还有一种做法叫多基因溯主建树,用的是STAR或MP-EST或NJst工具建树。

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2楼2016-05-04 13:20:40
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uuu555000

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送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2016-05-04 13:20:40
多基因串联建树可以用MEGA法,
还有一种做法叫多基因溯主建树,用的是STAR或MP-EST或NJst工具建树。

我用sequencemartix把4个基因数据合并,用的mega的ML法建树,这可以吗?
无所谓好或不好,人生一场虚空大梦,韶华白首,不过转瞬,惟有天道恒在,往复循环,不曾更改
3楼2016-05-04 13:36:33
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by uuu555000 at 2016-05-04 13:36:33
我用sequencemartix把4个基因数据合并,用的mega的ML法建树,这可以吗?...

不清楚你说的“我用sequencemartix把4个基因数据合并”是怎么做的?是把四个基因序列连成一个长序列吗?
4楼2016-05-04 14:46:48
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uuu555000

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2016-05-04 14:46:48
不清楚你说的“我用sequencemartix把4个基因数据合并”是怎么做的?是把四个基因序列连成一个长序列吗?...

是的
无所谓好或不好,人生一场虚空大梦,韶华白首,不过转瞬,惟有天道恒在,往复循环,不曾更改
5楼2016-05-04 14:55:56
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
uuu555000: 金币+5, 谢谢 2016-05-04 18:20:07
引用回帖:
5楼: Originally posted by uuu555000 at 2016-05-04 14:55:56
是的...

可以用MEGA做,经典做法。
6楼2016-05-04 17:58:48
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