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Apophasis

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何利用pymol分析受体与配体结合位点的氨基酸 已有1人参与

刚刚接触pymol软件,不会用。现在手里有受体与配体的PDB图(GRAMM-X分析得到的),但是不知道怎么用pymol软件查看二者结合位点处的氨基酸。有哪位大神能帮帮忙吗?谢谢了
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huangkd

新虫 (初入文坛)

亲,你这个问题解决没?我也不会,谢谢啦
2楼2017-01-13 09:41:44
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时光检索

金虫 (小有名气)

3楼2017-01-14 00:40:18
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keke226

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-01-14 21:40:29
可能需要根据受体和配体上氨基酸残基的距离进行推测吧。如果有氢键、盐桥等等相互作用的话,距离应该是需要在一定范围内的。
读书廿年倦写字,如今翻书不识志,若知眷书悔前程,无如渔樵未识时。三年担柴熟山性,三年苦网谙水汹,前程在心自倦舒,识志何用书中清。
4楼2017-01-14 20:47:06
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