24小时热门版块排行榜    

查看: 2901  |  回复: 14

peng85722

木虫 (小有名气)

[交流] 具有范德华力的分子晶体结构优化

各位虫子好,
最近在用vasp优化分子晶体,考虑了范德华力修正,优化用的ISIF=3,但是出来的原子位置不对,晶胞参数也与实验值发生很大偏差。我还尝试用实验晶格常数,采用ISIF=2,原子位置也是优化乱了。请问有经验的各位能否给些建议,是需要采用其他计算方法,比如杂化泛函还是用其他的计算软件。
谢谢!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

awdawdawdd

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1.EDIFFG可以再调小一点 例如 -0.01
2.你没有用vdw-DF functional啊,你是用了semi-empirical的Grimme的修正(DFT-D2)。
3.还有可能是你研究的材料本身的因素,如果你的energy surface太平了,有很多local minimal,那么也就是说有可能你的结构在室温下dynamics 很强 甚至是有disorder的,但实验的结构可能是一个average。另外你可以看看实验值结果怎么出来的,一般含有C H N这些light elements,用XRD的话不会特别准确,可能要做synchronchron XRD 或者 neutron diffraction,此时的话有偏差是正常的。

VDW-DF设置参见:
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... undqvist_et_al.html

计算VDW-DF时要把vdw_kernel.bindat放在你的计算的文件夹里

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

14楼2016-05-16 03:00:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peng85722

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by klskyqh at 2016-04-30 12:58:32
还有加u可能也有影响
...

没有过渡金属元素也要加U吗
5楼2016-04-30 16:26:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

jmlv

金虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
peng85722: 金币+5 2016-04-30 16:28:20
我计算最多的是金属晶体,加范德华力修正,计算没问题的。
分子晶体是指哪类晶体?
2楼2016-04-29 14:32:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

klskyqh

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
peng85722: 金币+1 2016-04-30 16:27:20
peng85722: 金币+4 2016-04-30 16:27:32
peng85722: 金币+5 2016-04-30 16:27:43
hse算试试?

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-04-30 12:56:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

klskyqh

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by klskyqh at 2016-04-30 12:56:20
hse算试试?

还有加u可能也有影响

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-04-30 12:58:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peng85722

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jmlv at 2016-04-29 14:32:44
我计算最多的是金属晶体,加范德华力修正,计算没问题的。
分子晶体是指哪类晶体?

就是简单含有C,H,N元素的分子晶体,对称性低一些
6楼2016-04-30 16:29:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
上传一下结构文件

发自小木虫Android客户端
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
7楼2016-04-30 18:38:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dxcharlary

专家顾问 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
vasp有专门考虑vdw的方法。
8楼2016-05-03 14:07:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

piaoma

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
peng85722: 金币+8 2016-05-04 14:29:36
估计是你哪设错了。我用vasp和QE都算过分子晶体,加了vdw修正,晶格参数都挺好的
9楼2016-05-04 10:49:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaomir

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
平面波程序优化局域化分子轨道,不擅长,可以尝试局域轨道基组的软件。
比如ATK或者ADF。
10楼2016-05-04 13:23:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 peng85722 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 材料专硕英一数二306 +8 z1z2z3879 2026-03-18 8/400 2026-03-23 20:49 by baobaoye
[考研] 333求调剂 +3 ALULU4408 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:04 by macy2011
[考研] 303求调剂 +4 元夕元 2026-03-20 4/200 2026-03-23 19:00 by macy2011
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程(085601) +3 WW.' 2026-03-23 5/250 2026-03-23 17:18 by 枫翼ljj
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap- 2026-03-22 9/450 2026-03-23 12:57 by yqdszhdap-
[考研] 317求调剂 +12 申子申申 2026-03-19 18/900 2026-03-22 22:23 by luoyongfeng
[考研] 材料与化工085600,总分304,本科有两篇sci参与,求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 寻找调剂 +4 倔强芒? 2026-03-21 4/200 2026-03-22 16:14 by 木托莫露露
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 资源与环境 调剂申请(333分) +5 holy J 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:42 by Catalysis25
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 265求调剂 +3 Jack?k?y 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:17 by JourneyLucky
[考研] 材料工程(专)一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 0703化学调剂 +4 18889395102 2026-03-18 4/200 2026-03-19 16:13 by 30660438
信息提示
请填处理意见