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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 哪位大神知道怎样设计氨基酸序列才能使环肽中D型和L型的氨基酸侧链位于环内或是环外？
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linlinnine

新虫 (初入文坛)

[求助] 哪位大神知道怎样设计氨基酸序列才能使环肽中D型和L型的氨基酸侧链位于环内或是环外？ 已有1人参与

急求！！看文献说D型和L型氨基酸交替排列的环肽的氨基酸侧链都位于环外，与环在同一平面，那怎样能使侧链朝向环内呢，有人知道吗？
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1楼 2016-04-28 08:39:30
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zhaoshuju

铜虫 (小有名气)
楼主知道答案了吗，能否向您请教
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2楼2020-09-22 10:52:57
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

挺有意思的问题.首先问题种的环肽是什么样的环肽?长度和侧链结构不同差异会很大.环外和环内是指立体构象中侧链是否暴露或出现在多肽分子表面还是通过相互作用在内部形成稳定结构把肽骨架暴露在分子表面?还是指平面投影的结果?一般情况下合环时的优势构象决定了环肽的结构,位阻,氢键和电荷一般不允许侧链都挤在环内部.一般都是亲水部分在外侧,疏水在内侧堆积,化学合成时要考虑侧链保护基的位阻和合成时的溶剂情况,要看序列情况和环的大小,似乎没办法统一分析.
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3楼2020-09-27 15:00:34
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