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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

[求助] VASP 使用NEB求过渡态之前的初始模型

最近在学习NEB找过渡态,根据paper建的结构,然后优化之后切表面,优化之后初始结构是在这个表面上放一个分子,但是优化过程中发现电子步不收敛,然后download了CONTCAR文件最后在Material Studio里面看了一下,发现我自己的模型里,上面放置的那个分子竟然散了,就是分子的很多键都断了,文章里是平行于表面的构型
我切表面之后的结构比文章里的厚度小一些,因为算得比较慢而且我是拿来练手,所以选了相对较小一点儿的厚度,而且这个表面切了之后还有一个表面重构的问题需要手动调一下,所以我就根据自己的表面厚度调整了一下,不知道是不是这里的原因,,,因为我的那个表面加一个分子之后的结构真的好难看。。。。请知道的师兄师姐给个建议吧???
上传的附件里,第一个paper里的构型,0.jpg 我的初始构型,,1.jpg 是电子步不收敛之后打开的CONTCAR对应的结构~~~~~~~~~求助求助求助
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

求助中~~~~~~
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2楼2016-04-27 19:59:42
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3楼2016-04-27 23:59:33
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醉梦江湖06

新虫 (初入文坛)

帮顶,虽然不知道说的什么
4楼2016-04-28 14:46:43
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

真的没有人呢
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5楼2016-04-29 10:45:18
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hehy114

金虫 (小有名气)

这个问题楼主有解决方案了么?初学者也有类似问题
6楼2016-05-04 05:00:07
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抖抖豆豆

新虫 (小有名气)

我也没找到原因是什么,不过我后来又重新建立了新的原子层厚度,然后优化之后比较合理了,从这里推测可能是因为原子层厚度太少然后对分子作用力太大~~~只是推测

发自小木虫IOS客户端
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7楼2016-05-04 16:48:24
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