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香雪1311

新虫 (初入文坛)

[求助] 植物愈伤组织总RNA提取结果 已有3人参与

最近在做植物的愈伤组织总RNA提取,用的是TIANGEN的总RNA试剂盒,跑的电泳图如下,但是测浓度和峰值后郁闷了,求高手指点~~
10管样品的260/280大概都在1.2-1.7,260/230在1.2-1.6,简直疯掉!!!(之前也提过几次,260/280值在1.8-2.1之间,这次不知道怎么了,瞬间懵掉
RNA浓度测定都是700ng/微升左右,电泳上样0.5微升,180V跑了20min。
想请教下各位有经验的前辈:
1.是不是有机试剂残留的原因?
2.我能不能用异丙醇或者无水乙醇把RNA重新沉淀一下,去掉杂质?如果可以,请问有没有这么做过的大神能分享下经验的?
3.我的RNA是做cDNA-AFLP用的,下一步打算做个mRNA的纯化,用的是上海生工纯化mRNA的试剂盒,过Oligo(dT)吸附柱,想问如果是试剂残留会对下一步纯化mRNA构成影响吗?
4.请问有用过上海生工纯化mRNA的试剂盒的大神吗?你们纯化前的总RNA起始用量是多少?那个说明上好像要0.5mg,感觉太多了……
新手金币有限,请各位见谅,但是感谢的心意仍然是满满的,期待您的答复,拜谢!

植物愈伤组织总RNA提取结果
0424.JPG
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
香雪1311: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢,我试试 2016-04-27 22:36:30
香雪1311: 金币+2 2016-05-01 22:45:58
样点多了而已,稀释后再跑胶试试,RNA应该没问题

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4楼2016-04-26 10:57:23
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jackyoung

新虫 (正式写手)

基本判定没有降解,单杂质偏多,有可能是有机试剂污染,从拖尾来看应该不是乙醇,后续因为需要反转录可以用酒精沉淀一下,方法如下:(1.氯仿抽提,2.终浓度70%乙醇+0.3M NaOAc置-20℃沉淀30+min或过夜后离心,3.70%酒精漂洗●根据总RNA量决定操作方式●后离心收集沉淀,晾干后溶于DEPC水)

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CestLaVie
6楼2016-04-28 00:21:42
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普通回帖

段李晓彤

银虫 (正式写手)

院士虫

2楼2016-04-26 05:11:08
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卡维斯

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的照片光圈参数太高了不是太清楚,但是我看还是还可以的。我们提取玉米愈伤一般是用CTAB法,CTAB是自己配置的,然后提取质量还是可以的。
3楼2016-04-26 10:44:17
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皈依bi

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
感觉太亮了吧,应该提的没问题。。
5楼2016-04-27 22:30:04
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香雪1311

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by jackyoung at 2016-04-28 00:21:42
基本判定没有降解,单杂质偏多,有可能是有机试剂污染,从拖尾来看应该不是乙醇,后续因为需要反转录可以用酒精沉淀一下,方法如下:(1.氯仿抽提,2.终浓度70%乙醇+0.3M NaOAc置-20℃沉淀30+min或过夜后离心,3.70% ...

非常感谢!
7楼2016-04-28 23:51:27
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香雪1311

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡维斯 at 2016-04-26 10:44:17
你的照片光圈参数太高了不是太清楚,但是我看还是还可以的。我们提取玉米愈伤一般是用CTAB法,CTAB是自己配置的,然后提取质量还是可以的。

谢谢!
8楼2016-04-28 23:58:27
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jackyoung

新虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 香雪1311 at 2016-04-28 23:58:27
谢谢!...

我们都用改进版的方法,CTAB有点儿老了………

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CestLaVie
9楼2016-04-29 00:04:56
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香雪1311

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by jackyoung at 2016-04-29 00:04:56
我们都用改进版的方法,CTAB有点儿老了………
...

我用的是试剂盒。之前用别人的TRIZOL试剂试验过,效果不行
10楼2016-05-01 22:44:59
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