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chumjun

新虫 (正式写手)

[求助] 计算ECD定绝对构型 已有2人参与

一个萜类化合物,在定构型时遇到问题,请教下此化合物能不能通过计算ECD定绝对构型,文献此类有通过做反应,或者计算旋光的方法,好像计算旋光会有一定的误差,不知可不可行?非常感谢!

计算ECD定绝对构型
捕获.PNG
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jwdongyn

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
计算 VCD 也可以确定绝对构型

发自小木虫IOS客户端
2楼2016-04-21 23:33:38
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爱梦想做自己

铜虫 (小有名气)

柔性比较大,计算ECD构象应该会很多,可以试一下。

发自小木虫Android客户端
3楼2016-04-22 00:03:21
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殷赋科技

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chumjun: 金币+20 2016-05-19 12:24:32
可通过ECD计算确定其绝对构型。ECD计算的一般步骤为:1)构象分析;2)ECD计算与玻尔兹曼加权平均;3)科顿效应解释。(“http://www.yinfotech.cn/services/cheminfo/ecd”)
在第一步构象分析中,由于该化合物构象柔性键较多,产生的构象会很多,不利于ECD计算。同时,它有多个手性碳,也大大增加了计算量。建议:首先采用NOESY谱确定相对构型,然后替换磺酰长链,简化结构后,再计算ECD。
计算步骤可参考”http://www.yinfotech.cn/cases/case2“。或将研究内容发送到info@yinfotech.cn,由我们协助你解决问题。
4楼2016-04-25 16:16:01
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