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Catherine-ru

金虫 (小有名气)

[交流] 来,看一下中国科研用户都在研究啥基因?

GCBI网站为中国科研用户提供基因检索服务,总共提供172176条基因的检索,物种主要人,小鼠,大鼠。

提供的信息主要包括基因的介绍,其转录本信息,功能信息,参与的信号通路,靶向该基因的所有miRNA列表,已有的SNP突变位点信息,基因组浏览图,以及该基因相关的文献等。



GCBI网站一年来,中国科研用户共检索了32145次,共有23193条基因被检索。



那么让我们来看看,大家都在关注哪些基因?



可以看出某些基因是大家较为熟知的基因,但也有部分较新的基因出现在基因检索排名的榜单里,同时对应了基因相关的pubmed文献数量,能看出研究越多的基因其所受的关注度未必高,这也说明中国科研人员并不是一直追逐热点基因,也会选择一些研究较少的基因作为研究对象。

接着,我们挑选了检索排名前100的基因列表,对这些基因进行了GO和pathway分析看这些基因是否集中于某些功能或某些pathway,以便更全面的挖掘一些信息。



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从pathway的结果来看,这些基因基本上都集中在多种恶性肿瘤的通路中以及肿瘤发生、转移相关的重要通路中。



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从GO分析的结果来看,这部分基因的功能大多集中在细胞生长、增殖、凋亡调控的功能,以及免疫调节相关功能,结合pathway的结果,这些基因的功能基本都与恶性肿瘤的发生、增殖、转移相关。



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可以看出这些基因存在较为密切的上下游关系,而MAPK1作为核心基因,其调控的通路基本都与肿瘤相关。

从以上三个分析结果可见,中国科研用户的研究领域存在着非常集中的特点,结合之前文献检索的数据可以看出,中国科研人员确实在努力集中力量攻克肿瘤研究的难关。

以上数据均基于GCBI的数据来源统计,想要了解中国科研用户都在检索什么文献,请关注GCBI公众号,在公众号回复:169查看文章。



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