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两个单体形成结合物的能量问题
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两个单体A,B 用RPM3 法分别进行优化,优化后,把它们的结构以一定的距离对接起来形成结合物C,他们之间没有发生任何化学反应,只有弱相互作用。将C也用RPM3法优化,优化后总能量降低了,结合物中A.B的构象均发生了变化。但是很奇怪的是。将 A.B提取出来用RPM3法计算单点能,发现较结合之前一个能量升高一个能量降低。按照我的理解和所参照的部分文献来看,应该两个单体形成包何物后,他们构象发生了变化,各自的能量都要升高,怎么一个会降低呢,想不明白,查了下 我的操作没有什么错误啊。求高人指点哦~~ 万分感谢!!!!! [ Last edited by xiaokeaini83 on 2008-10-24 at 19:49 ] |
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