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猴面花

木虫 (正式写手)

[求助] 知道核酸序列怎么用DNAMan找orf呢？ 已有2人参与

查了下，一般都是用mRNA，但是我这里只有碱基序列，怕转录后再翻译结果有误差，求帮忙，多谢指点啦！

@biostar2009 @飞约疯人院 发自小木虫Android客户端
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人不能两次踏进同一条河流。。。
1楼 2016-04-15 15:02:16
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娟恋幸福

新虫 (小有名气)
protein选项可以

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2楼2016-04-15 19:34:35
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
先确定你的序列中没有内含子，才可以用DNAMAN搜索ORF，方法如下：
http://kczx.xjau.edu.cn/G2S/Temp ... p;linkpageID=116621
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3楼2016-04-15 20:35:34
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猴面花

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2016-04-15 20:35:34
先确定你的序列中没有内含子，才可以用DNAMAN搜索ORF，方法如下：
http://kczx.xjau.edu.cn/G2S/Template/View.aspx?courseType=1&courseId=285&topMenuId=115736&menuType=1&action=view&typ ...

我的是病毒基因序列

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人不能两次踏进同一条河流。。。
4楼2016-04-16 09:22:40
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

病毒的可以用DNAMAN分析
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5楼2016-04-16 21:31:52
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猴面花

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by stone2239 at 2016-04-16 21:31:52
病毒的可以用DNAMAN分析

这个链接我知道哎，没看到直接用核酸序列能找ORF啊，我把核酸序列输入进去后，那个找ORF的选项是灰色的。不知道这是怎么了。。
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人不能两次踏进同一条河流。。。
6楼2016-04-18 09:28:25
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qaz199018

金虫 (小有名气)
DNAstar里的seqbuilder试试

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~~~
7楼2016-04-18 11:39:24
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 猴面花 at 2016-04-18 09:28:25
这个链接我知道哎，没看到直接用核酸序列能找ORF啊，我把核酸序列输入进去后，那个找ORF的选项是灰色的。不知道这是怎么了。。...

序列没有成功载入，你可以后退看下其他相关视频。成功载体后是可以查找ORF的。
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8楼2016-04-18 13:23:25
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Ivy尘

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
Oligo 7-Analyze-Open reading Frames 很方便啊~
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9楼2016-04-18 14:50:57
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