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【小福利】VASP频率计算可视化方法
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最近用VASP程序计算了频率，发现没有可视化的现成的程序。 于是在网上搜索，在http://211.99.222.55/disparticle ... 0306&pos=28这个网页发现了一个好心的网友把之前自己写的程序公布出来了。并且提供了可视化的软件。 于是我在该网友写的代码的基础上然后修改了一下，可以生成mkl格式的频率文件(查看软件下载地址：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3657705&fpage=1)。 需要的文件： 1. OUTCAR 2. CONTCAR.xyz （该文件可以通过VESTA软件（下载地址：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=9938976&fpage=1&target=blank）将CONTCAR转化一下即可：打开-->export data） 程序要求输入体系总原子数目，频率计算中自由原子数目。 注意：生成的OUTCAR.mkl文件不要忘记从unix转为dos格式：unix2dos OUTCAR.mkl; 在windows下面运行的可能不需要转 附：molekel4.3.win32软件使用方法 (1) 运行molekel4.3.win32.exe文件 (2) 在出来的三个窗口中的黑色背景窗口 右击-->load-->mkl, 这个时候弹出文件选择框，用鼠标通过单击选择上要查看的文件(如果无法通过鼠标单击选择文件，可以通过输 入文件全名的办法来指定文件) (3) 这个时候体系结构会加载进入黑色背景窗口， <1>鼠标左键可以旋转体系，<2> shift +鼠标左键 可以平移体系，<3> shift+ctrl+鼠标左键 可以放大缩小体系 (4) 加载频率信息：右键-->Animate-->Frequency弹出一个频率选择控制小窗口 (5) 为了方便看原子的振动方向，勾选“show arrows” (6) choose可以对频率进行选择，给出的频率是用cm-1作为单位的，选择完毕点击accept,这时在频率选择控制小窗口显示选择的振动模式波数， (7) 点击 频率选择控制小窗口 的 animate，即可以看到振动模式 (8) 点击stop, 然后重复(6)-(7)两步可以在不同振动模式之间切换 |
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2016-04-12 23:13:16, 1.12 M
2016-04-12 23:13:47, 3.29 K
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3楼2016-04-17 23:14:53
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您好，看了你的很多帖子，有一个关于siesta计算的问题想请教您。 我准备用siesta计算画出掺一个氮的石墨烯的能带结构图，但计算完后各个K点的数据完全一样，也就是说能带图画出来会是许多平行线，我觉得可能是siesta程序里k点设置出问题了，我把fdf文件贴在后面，麻烦您指出一下问题。 |
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2016-04-21 00:27:47, 9.77 K
4楼2016-04-21 00:28:36
8楼2016-08-12 14:41:45
13楼2017-01-09 22:27:43
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aa560749818楼
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