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求助：关于差异表达基因列表中p值 已有1人参与
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我实验用到的是Affymetrix公司的芯片，给的差异表达基因列表里有p-value（这应该是原始p值吧），bonferroni(p-valve)、 stepup(p-value)（这俩是调整后的p值，用的应该都是FWER控制），qvalue(p-value)（调整后p值，用的应该是FDR控制）； 设定的显著水平alpha为0.05； 最终筛选时是用stepup(p-value)与alpha比较的，也就是采用了FWER控制； 我看相关类似文献以及学习FDR过程中，发现FDR控制在微阵列数据表达的差异检验中用的更多， 所以我的问题是，我的列表中，用FWER控制筛选产生的影响大么？有必要改成使用FDR么？如果用FDR的话，是否是将这里的qvalue(p-value)与0.05比较？ 希望看见的大能们能帮下忙，统计学没有学过，这点知识还是这两天恶补的，错误的地方希望能指正。 |
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