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Catherine-ru金虫 (小有名气)
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[交流]
人胃上皮干细胞体外扩增及其对细菌感染的反应
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推荐理由 1. 数据所发表的文章基本都是在展示实验结果，几乎没有展示数据分析方法，我们可以将可比较的组分别进行比较，做进一步的数据挖掘。 2. 可以将正常部分的对照组、类器官组、腺体组进行比较。将胃窦部分的类器官组、腺体组、正常对照组进行比较。或者类器官/腺体的正常与胃窦部分进行比较。 3.文章是用Hugene2.0芯片，我们可以通过GCBI平台做lncRNA分析，从而得到lncRNA相关的数据。 文献信息 In Vitro Expansion of Human Gastric Epithelial Stem Cells and Their Responses to Bacterial Infection. PMID: 25307862 影响因子: 16.716 背景介绍 我们先前从鼠的组织(肠、胃、胰腺和肝脏)和人类的肠道和胰腺建立长期，三维培养器官。在这里，我们描述了长期三维培养人的胃干细胞的条件要求。这项技术可以应用于研究上皮对感染幽门螺杆菌的反应。 方法与结果 我们是从人类胃外科手术样本库产生的类器官。培养条件是基于小鼠的胃部和人的肠道系统被开发的。我们用显微注射螺杆菌感染器官。上皮反应被用微阵列测量和定量PCR分析。 人的胃细胞在三维培养中被无限扩大。我们培养的细胞是来自健康的胃组织，单独分类的干细胞，或者肿瘤组织。类器官对于各自组织基于其组织学、表达标记和整倍性保持他们的许多特征。类器官是从4个家系的胃和腺体的健康组织的表达标记物得到的。他们通过添加烟酰胺和撤销WNT，可以直接明确的表达胃腺的家系，或者是胃小凹。虽然胃小凹家系对细菌感染只有临界反应，但是胃腺家系发生了很强的炎症反应。 结论 我们研发出一个培养人胃类器官的系统。这个系统能被用于研究幽门螺杆菌感染和其他的胃的病理学。 样本信息 芯片类型为：GPL16686 [HuGene-2_0-st] Affymetrix Human Gene 2.0 ST Array [transcript (gene) version]. 样本数量：19个 GEO编号：GSE60557 物种：人 人的组织是从17例局部或全部胃切除术病人中获得，其中12例男，5例女，年龄41-87岁。10个病人患有胃癌，7个病人患有食道癌。 数据复用方案 正常部分三组分别进行比较，胃窦部分两组进行比较， 类器官组进行比较，腺体组进行比较。并且进行lncRNA差异结果的比较。  需要查看方案运行结果，请到实验室联系服务顾问，申请加入胃癌联盟实验室。 GCBI周年庆 4波好礼豪送不停 活动时间：2016.04.05-2016.05.27 第一波大礼： 4月5日~4月17日，购买GCBI年账户立送价值5688元的Apple ipad pro一台 购买GCBI半年账户立送价值2788元的ipad mini4一台或Apple watch一部任选其一 购买GCBI月账户立送迪士尼双人门票或亚马逊Kindle电子书任选其一 更多活动信息请扫描下方二维码关注GCBI知识库并回复“周年庆”； 或点击活动页：GCBI周年庆活动  |
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