24小时热门版块排行榜    

查看: 625  |  回复: 0

Catherine-ru

金虫 (小有名气)

[交流] ETS2在非小细胞肺癌中的对肿瘤和致癌基因的抑制作用

推荐理由

1.该批样本来源可靠,其中110个组织样本的芯片数据,本文中只利用了差异表达结果;

2.所发表的文章主要研究了ETS2这一个基因的作用机制,对于其他的差异表达基因并没有做深入探讨。


文献信息


ETS2 mediated tumor suppressive function and MET oncogene inhibition in human non-small cell lung cancer.
PMID: 23659968

影响因子: 8.722
本文主要探讨ETS2在肺癌发病机制中的功能。本文使用了80例肺腺癌样本与30例正常样本进行芯片检测(芯片:affymatrix HuGene1.0),实验结果表明,在肺腺癌样本中ETS2的表达是显著降低的。其次,使用了201例非小细胞肺癌(NSCLC)组织样本进行了免疫组化实验来检测ETS2蛋白的表达,并将该结果与病例临床信息进行了log-rank和Kaplan-Meier的统计。结果显示免疫组化结果中EST2的低表达和非小细胞肺癌和肺腺癌的低复发率显著相关;而且EST2能够显著抑制肺癌细胞的增殖、转移和入侵。另外最后使用干扰和过表达实验评估各种恶性表型中EST2在转录组中的表达。芯片结果和通路分析显示敲除EST2后,可以激活HGF通路。另外研究发现EST2能够抑制MET的磷酸化作用,而且敲除MET也能够显著减弱特异干扰EST2后的细胞入侵。而且,敲除EST2后也能增强HGF诱导的MET磷酸化,细胞转移和入侵。由上述结果可知,EST2在非小细胞肺癌中发挥抑制肿瘤的作用是通过首先抑制原癌基因MET实现的。


样本信息

样本来源于安德森癌症研究中心肺癌专项研究组的样本库。 样本分组依照2004 世界卫生组织(WHO)分类系统。
样本数量:110个
GEO编号:GSE43458
物种:人

数据复用方案

1.研究非吸烟样本情况下,肺腺癌样本与正常样本的差异表达,并探索这些基因的功能与通路以及这些基因间的相互作用关系。

2. ETS2干扰实验,通过共表达网络分析,得到与ETS2表达相关性高的基因,研究这些基因的相关功能是否与肺癌有关。

需要查看方案运行结果,请到实验室联系服务顾问,申请加入肺癌联盟实验室。


GCBI周年庆
4波好礼豪送不停

活动时间:2016.04.05-2016.05.27

第一波大礼:
4月5日~4月17日,在线支付17000购买GCBI年账户立送价值5688元的Apple ipad pro一台

更多好礼请点击:GCBI周年庆活动
回复此楼
勤学、修德、明辨、笃行
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Catherine-ru 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见