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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 【求助】CATALST结果分析
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chemozhang

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】CATALST结果分析

CATALST结果中一个好的药效团需要config值<17

有个问题想请教一下高手,  config的值是怎么计算出来的, config<17又代表什么意义呢

若结果着Config值>17(18左右), 而RMS值很好, 预测活性也比较好, 那这个药效团算是好还是不好?  Config的值有多重要?

[ Last edited by mingdong on 2009-9-19 at 08:06 ]
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故地如重游月圆更寂寞
1楼 2008-10-22 19:15:38
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a-cui

银虫 (正式写手)
★ ★
spur(金币+2,VIP+0):3Q!感谢提供帮助！
Config值是一个固定费用（fixed cost）值，大小取决于药效团模型空间的复杂程度，跟优化后药效团的数目有关，可被看作药效团模型空间的熵。当 Config值大于17时要考虑换训练集分子。
我一般先考虑delta cost值和correlation， Config值最后考虑。不过如果预测活性都很好的话，那就别太在意config了。整个费用函数基于奥坎姆剃刀规则，它对模型的评价本来就只能部分参考。
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2楼2008-10-23 10:04:58
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