24小时热门版块排行榜    

查看: 2061  |  回复: 16

凉yeah

铜虫 (小有名气)

[求助] lammps模拟前的建模 已有1人参与

在用lammps进行分子动力学模拟时,石英玻璃的模型怎么建立?应该怎么写程序啊?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zzyhyuan

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有几种方法可以试的:
1. 去找SiO2的CIF文件,比如 a-quart (a_quartz_2300370.cif),或 beta_Crystobalit (beta_Crystobalit_1010944.cif)
这些个晶体文件。在:
http://www.crystallography.net/search.html
把后面那串数字当 COD ID 进行搜索就能找到了你要的结构了。

2. 自己写个程序,按组分比和密度,随机生成一定数量的分子,放入立方盒子,注意控制任意2原子的间距最好在1.5以上,这样你就得到了个随机分布的结构了。
程序思路是:随机生成一个坐标,并不断跟之前生成的坐标求距离,保证距离大于1.5,另外注意盒子的尺寸是由原子质量除于密度得到的。这个应该不算太难的
-------------------------------------------------

得到结构后只要将结构在高温下 熔融-再降温,就能得到玻璃了。
原来爱本身可爱在于束缚
7楼2016-04-05 18:07:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

凉yeah

铜虫 (小有名气)

2楼2016-04-03 15:50:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凉yeah

铜虫 (小有名气)

3楼2016-04-03 15:52:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凉yeah

铜虫 (小有名气)

帮帮忙,谢谢 啊
4楼2016-04-03 15:58:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
5楼2016-04-05 00:42:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chen4330453

新虫 (初入文坛)

ms中不是有石英的模型吗?你是做什么的

发自小木虫Android客户端
6楼2016-04-05 10:54:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzyhyuan

木虫 (著名写手)

哦,对了,如果不想写程序,还可以试试使用 Aten ,里面有随机生成 H2O 的例子,用来生成  SiO2 也是没问题的,而且那个软件可以直接导出 lammps.input
原来爱本身可爱在于束缚
8楼2016-04-05 18:09:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凉yeah

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by chen4330453 at 2016-04-05 10:54:50
ms中不是有石英的模型吗?你是做什么的

刚开始学,还没用过ms,好像装软件的时候licence文件一直装不上。老师让我做ceo2划石英玻璃的反应动力学方面。。。。。
9楼2016-04-06 12:38:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凉yeah

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by zzyhyuan at 2016-04-05 18:09:36
哦,对了,如果不想写程序,还可以试试使用 Aten ,里面有随机生成 H2O 的例子,用来生成  SiO2 也是没问题的,而且那个软件可以直接导出 lammps.input

谢谢你。
10楼2016-04-06 12:39:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 凉yeah 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +3 yang182083 2026-08-06 4/200 2026-08-07 11:07 by 虫友是什么虫
[基金申请] 基金中了 +11 laoda193707 2026-08-06 11/550 2026-08-07 10:54 by TT和NN
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 18/900 2026-08-07 10:13 by naalan7001
[基金申请] 听说今天filecode变了 +21 布布和一二 2026-08-06 44/2200 2026-08-07 10:11 by 布布和一二
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +4 archvillain 2026-08-06 8/400 2026-08-07 08:06 by 带你看大海
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 6/300 2026-08-06 20:19 by 苏知砚
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备? 50+3 kf2781974 2026-07-31 12/600 2026-08-06 15:11 by eddyin
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[教师之家] 咨询面上基金 +4 李长云 2026-07-31 7/350 2026-08-06 11:20 by 李长云
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +22 低垂的野花 2026-07-31 30/1500 2026-08-05 18:03 by 低垂的野花
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +3 哈哈114477 2026-08-01 3/150 2026-08-04 15:40 by tegsgjy20
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 娱乐 +4 Tide man 2026-08-03 4/200 2026-08-04 11:51 by wgch518
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见