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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms动力学模拟氧化铝晶体生长出错
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jianqi1220

木虫 (小有名气)

[求助] ms动力学模拟氧化铝晶体生长出错

新手求助：
    用forcite模块分子动力学模拟氧化铝晶体生长出现以下错误：
An unphysical integration step (>100 Angstroms) has been detected.
Try relaxing the structure with geometry optimization, reducing the time step,
reducing the temperature or a combination of these.
      选的是NVT系统，温度试过从973K到273K，步长从1fs到0.01fs（再小好像设不了了），初始晶胞也进行过几何优化。
求助什么是一个非物质的集成步骤？或者计算中哪一个部分选错了？
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1楼 2016-04-03 10:45:55
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jianqi1220

木虫 (小有名气)
自己顶一下，不要沉了啊
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2楼2016-04-05 22:03:13
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青大柯尔斯滕

新虫 (正式写手)
我遇到了同样的问题。。。也有这提示。。

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3楼2016-04-20 14:10:33
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jianqi1220

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 青大柯尔斯滕 at 2016-04-20 14:10:33
我遇到了同样的问题。。。也有这提示。。

我当时建的4x4超晶胞出了这个问题，换小的以后就可以算了，你用初始的晶胞往下算试一试。
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4楼2016-04-20 15:27:44
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青大柯尔斯滕

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jianqi1220 at 2016-04-20 15:27:44
我当时建的4x4超晶胞出了这个问题，换小的以后就可以算了，你用初始的晶胞往下算试一试。...

楼主，我用的是2*2*2的，不能再小了啊。。再小就没有周期性了。。我给原子加了力场之后，它就可以运行了，可我之前跑分子动力学的时候都不需要特意加力场，这对结果会有什么影响嘛？新手啊，请多关照！

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5楼2016-04-20 15:33:31
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jianqi1220

木虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 青大柯尔斯滕 at 2016-04-20 15:33:31
楼主，我用的是2*2*2的，不能再小了啊。。再小就没有周期性了。。我给原子加了力场之后，它就可以运行了，可我之前跑分子动力学的时候都不需要特意加力场，这对结果会有什么影响嘛？新手啊，请多关照！
...

力场会默认加，也可以自己改，不过我感觉这两个应该没什么关系吧，你新加的是什么力场啊
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6楼2016-04-20 18:08:55
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青大柯尔斯滕

新虫 (正式写手)
跑了快一半了又中断了。。该怎么办。。。。加的CVFF

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7楼2016-04-20 20:14:12
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青大柯尔斯滕

新虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 青大柯尔斯滕 at 2016-04-20 15:33:31
楼主，我用的是2*2*2的，不能再小了啊。。再小就没有周期性了。。我给原子加了力场之后，它就可以运行了，可我之前跑分子动力学的时候都不需要特意加力场，这对结果会有什么影响嘛？新手啊，请多关照！
...

老师刚才和我说，可以换个MD的算法试试，我不太理解什么意思，请问楼主解决了这个问题了吗？

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8楼2016-04-20 21:14:17
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