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18716248350

新虫 (小有名气)

[求助] ssODN设计

设计了3个sgRNA靶点,ssODN是不是也要设计三个啊?
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ken19860823

木虫 (正式写手)

2楼2016-04-02 22:05:43
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ken19860823

木虫 (正式写手)

ssodn一般200bp,你的切割位点不会差这么多,一般不用重复设计,看目的。ssodn一般做点突变的,切割位点不能离修复位点,针对点突是不会需要设计三个的。做ko和ki没用ssodn做过,不清楚

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做基因修饰的老菜鸡
3楼2016-04-02 22:09:10
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18716248350

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ken19860823 at 2016-04-02 22:09:10
ssodn一般200bp,你的切割位点不会差这么多,一般不用重复设计,看目的。ssodn一般做点突变的,切割位点不能离修复位点,针对点突是不会需要设计三个的。做ko和ki没用ssodn做过,不清楚
...

哦哦!好的!谢谢!我想用它敲掉一小段序列跑胶的时候能和野生株有区别就行

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4楼2016-04-02 23:29:33
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sibei1

新虫 (小有名气)

这大小90即可,设计菲对称左右臂效果很好。今年二月份在nature biotechnology上面一篇文章,你看一下

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时代遗孤
5楼2016-04-27 04:09:51
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sibei1

新虫 (小有名气)

还有,设计那么多是筛选活性较高的吧,如果是这样,那就设计一条ssodn,如果是改正较远的位点要设计3个ssodn.注意位置近的话(一条ssodn能覆盖,就不需要设计多条)

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时代遗孤
6楼2016-04-27 04:12:34
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