24小时热门版块排行榜    

查看: 1702  |  回复: 9

709944890

金虫 (小有名气)

[求助] Gaussian09计算 已有1人参与

小弟刚学Gaussian09,在windows上运行,想做C60的拉曼光谱,这么设定的
%chk=fuller.chk
%mem=500MB
%nprocshared=5

# opt freq=raman b3lyp/3-21g geom=connectivity

运行了好久,gaussian窗口有提示
Inverted reduced A of dimension    67 with in-core refinement.
End of Minotr Frequency-dependent properties file   721 does not exist.
End of Minotr Frequency-dependent properties file   722 does not exist.
Symmetrizing basis deriv contribution to polar:
IMax=3 JMax=2 DiffMx= 0.00D+00
运行了很久了,是不是出了什么问题。现在已经暂停。请问大神该怎么办。

PS:在网上看到一个人写的%chk=B60Sc20.chk
下面有网友回复说:“从文件名看,有60个B,20个Sc,你只给了800M内存绝对是不够用的。另外,Sc用6-31g*值得商榷,何况20个Sc,2个Sc都够你的CPU跑的,
要用你的基组跑20个Sc的体系,除非你用未来世界的超一流超级计算机。
若真是这个体系,请改用分子力学吧,别把计算机累死了,否则按现在计算机的
能力,我猜能跑到你双鬓发白。。当然,如果我猜错了体系就另当别论了。”
对于一个菜鸟的我都看不懂上面说了什么?还请大神解释一下。谢谢啦!
回复此楼
坚持,淡定,信念
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
709944890: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-04-01 18:46:40
意思简单来说就是体系太大给的内存和基组都太小,不仅要算到地老天荒而且就算算出来了结果还不可靠。。。

很多人都会拿一个大体系来问“啊高斯算了很久还是没有结果是不是出问题了啊balabala的”,然后问他们算了多久,他们大多回答“啊,1个小时左右、2个小时,1天”云云,然后我就想掀桌子。。。所以说偷懒的拿来主义不可取。

以上仅是吐槽,下面解答你的疑问:
一般来说高斯计算的速度和体系,方法,基组,计算任务,计算机硬件条件等等都有关系。简单来说与硬件条件成反比,与其他成正比。
在似乎于100%的情况下,只要高斯本身不报错,就表明它一直在计算着,当然我在windows里碰到过“停在那不算”的情况,但是就一次。。。
拿你的体系来说,60个C,虽然你的方法和基组很小,但是还是需要算蛮久的,所以你就让它继续算着,等到高斯报错,我们再来具体分析。
2楼2016-04-01 07:00:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tawfischer

木虫 (小有名气)

有个疑问,win版能5核么?

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2016-04-01 07:27:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

709944890

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by tawfischer at 2016-04-01 07:27:11
有个疑问,win版能5核么?

那不是5个进程吗?

发自小木虫Android客户端
坚持,淡定,信念
4楼2016-04-01 07:47:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tawfischer

木虫 (小有名气)

5楼2016-04-01 08:05:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

709944890

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2016-04-01 07:00:19
意思简单来说就是体系太大给的内存和基组都太小,不仅要算到地老天荒而且就算算出来了结果还不可靠。。。

很多人都会拿一个大体系来问“啊高斯算了很久还是没有结果是不是出问题了啊balabala的”,然后问他们算了 ...

那请问那上面提及的'B,Sc'是什么意思呢?还有我该如何设定mem,nproc呢?

发自小木虫Android客户端
坚持,淡定,信念
6楼2016-04-01 10:16:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

709944890

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by tawfischer at 2016-04-01 08:05:52
我印象中最多四个

其实这个计算我实在两个计算机上做的。在win7上没写mem,和nproc这两个,这两个我是写在一台linux上的。

发自小木虫Android客户端
坚持,淡定,信念
7楼2016-04-01 10:23:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by tawfischer at 2016-04-01 07:27:11
有个疑问,win版能5核么?

32位最多4个,64位应该无限制,只不过我没见过64位win版的。。。
8楼2016-04-01 12:49:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 709944890 at 2016-04-01 10:16:46
那请问那上面提及的'B,Sc'是什么意思呢?还有我该如何设定mem,nproc呢?
...

B和Sc请去查元素周期表。mem和nproc根据你的体系和硬件条件设置。nproc有多大设多大,mem的话,高斯说明书里效率这一章讲了对于调用内存的估算,可以看看。
9楼2016-04-01 12:51:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

709944890

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by tawfischer at 2016-04-01 07:27:11
有个疑问,win版能5核么?

谢谢啦!

发自小木虫Android客户端
坚持,淡定,信念
10楼2016-04-01 18:47:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 709944890 的主题更新
信息提示
请填处理意见