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Association of Interleukin-28B Genotype and Hepatocellular Carcinoma Recurrence in Patients with Chronic Hepatitis C 白介素28B 基因型与慢性丙肝患者中的肝细胞癌复发的关联 https://www.gcbi.com.cn/gclib/html/pubmed/detail/23426277 PMID: 23426277 影响因子：8.722 GEO相关样本： GSE41804 物种：人 文章内容 目的： 一些SNP在白介素28B (IL-28B)的位点最近已被证明是与慢性丙型肝炎(CHC)抗病毒治疗疗效有关。然而，我们研究的IL-28B基因型和接受药物治疗的肝细胞癌患者的生物学与临床结果之间的关联，这样一个与肝细胞癌(HCC)的相关性是未知的。 方法与结果： 带有慢性丙型肝炎的183例肝细胞癌患者的基因分型，他们是被通过肝切除或射频消融(RFA)进行处理的，并且结果分析用来确定IL-28B基因型(rs8099917)和临床结果之间的关联。20例肝细胞癌患者和另一部分的91名慢性丙型肝炎患者的基因表达被用微阵列和基因集富集分析。同时也进行了组织学和免疫组织化学分析。 rs8099917基因型的TT、TG和GG比例分别是67.8%(124/183)，30.6%(56/183)，和1.6% (3 /183)。多变量Cox比例风险分析表明IL-28B TT基因型是明显的与HCC复发相关(P= 0.007；HR， 2.674； 95% 置信区间 1.16–2.63)。微阵列分析表明在肝脏样本中干扰素刺激的基因与在IL-28B TG/GG基因型肿瘤组织的免疫相关基因高表达。组织学研究结果表明，在TG / GG基因型，更多的淋巴细胞渗透到肿瘤组织中。 结论： IL-28B基因型与CHC患者HCC复发、基因表达、和组织调查结果有关。 样本信息 文章中共40个样本。 Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array major minor 20 20 推荐理由： 1. 文中对本批数据只做了层次聚类分析和富集度分析，我们可以利用GCBI平台现有的功能进行更多的分析进一步得到更可靠的结果。 分析实验室 数据复用方案：分别将IL-28B rs8099917的TT基因型和TG/GG基因型的样本的差异结果进行通路分析，从中发现与肝癌相关的信号通路。 史上最实在的买就送：ipad、iwatch、Kindle和迪士尼，你想要啥？ 是的 GCBI迎来了第一个周年庆 谢谢您的认可 我将继续和您同在 请收下我的礼物 不过，请问你最想要哪个礼物呢？ 活动详见GCBI知识库 |
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