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Catherine-ru

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[交流] PLCE1 mRNA和蛋白的表达与胃食管鳞状细胞癌和胃腺癌患者的生存

PLCE1 mRNA and protein expression and survival of patients with esophageal squamous cell carcinoma and gastric adenocarcinoma
PLCE1 mRNA和蛋白的表达与胃食管鳞状细胞癌和胃腺癌患者的生存
https://www.gcbi.com.cn/gclib/html/pubmed/detail/24867265
PMID: 24867265
影响因子：4.125
GEO相关样本：476（GSE29272、GSE23400）
物种：人

文章内容

背景：

在中国， PLCE1 (10q23)种系基因的变异已经证明与食管鳞状细胞癌(ESCC)和胃癌的风险是一致相关的。在癌与正常配对组织中我们评估PLCE1 mRNA和蛋白的表达，和他们与生存的关系。

方法与结果：

在ESCC (n=132)的配对的癌与正常组织，胃贲门癌(GCA, n=62)和非贲门癌(GNCA, n=72)中，PLCE1 mRNA被用三种探针样式的Affymetrix GeneChip U133芯片进行分析。我们在ESCC(n=303)配对的癌与正常组织和GCA (n=298)与GNCA (n=124)肿瘤用免疫组织化学从组织芯片上检测PLCE1蛋白。

与正常组织相比，PLCE1 mRNA表达在ESCC 肿瘤中(P=0.03, probe_205112_at)是显著减少的，在GCA和GNCA肿瘤(P<0.0001，each probe)中也是一样。在ESCC肿瘤(P=0.51)中蛋白表达不是显著地减少。在ESCC (对于最高的 vs 最低的四分位数9.6个月； P -trend=0.02)中，增强的肿瘤-正常的mRNA的fold change (probe_205112_at)是与更长的生存期密切相关的。增强的mRNA的肿瘤-正常fold change(probe_205111_at)是与GCA(对于最高的四分位数10.7 个月；P-trend =0.04)更长的生存期密切相关，但对于GNCA病例(P=0.72)却不是。类似于mRNA，在ESCC中提高肿瘤-正常的蛋白的fold change也与提高生存率密切相关（对于最高的四分位数8.1个月，P -trend=0.02）。

结论：

在ESCC (one probe only) 和 GCA 肿瘤观察PLCE1 mRNA表达的异常调节，并且这个变化的PLCE1表达看上去可能是和癌症的预后相关的。PLCE1的潜在作用在ESCC 和GCA早期检测和治疗中需要进一步调查研究。

样本信息

文章中共476个样本，平台支持的有374个样本。食管鳞状细胞癌与癌旁共106个，胃贲门癌与癌旁124个，非胃贲门癌与癌旁144个。

Affymetrix Human Genome U133 Array

食管鳞状细胞癌(ESCC)：

胃贲门癌(GCA)：

非胃贲门癌(GNCA)：

推荐理由：

1. 文章中是分别对胃食管鳞状细胞癌和胃腺癌的基因和蛋白层面进行了研究，两个方面结合的研究结果会更加客观可靠。

2. 对于胃食管鳞状细胞癌、胃贲门癌和非胃贲门癌研究的文章比较多，本文是综合了以上三者进行的研究，容易发现一些更有价值的信息。

分析实验室

数据复用方案：分别将胃食管鳞状细胞癌、胃贲门癌和非胃贲门癌的癌与癌旁的差异结果进行通路分析，可以从中发现PLCE1这个关键基因所在的信号通路。