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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 用lammps算热传导系数如何算virial部分的贡献？
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Janetwx

新虫 (小有名气)

[求助] 用lammps算热传导系数如何算virial部分的贡献？

rt. 本人想把kappa matrix分解成KE,PE 和virial部分，已搞定了标量的KE和PE部分，但由于stress 是6个element的vector，不太清楚如何算virial的heat flux vector S*v.

compute myStress all stress/atom virial
variable mySvx atom c_myStress*vx
variable mySvy atom c_myStress*vy
variable mySvz atom c_myStress*vz
compute mySvx all reduce sum v_mySvx
compute mySvy all reduce sum v_mySvy
compute mySvz all reduce sum v_mySvz
fix JJS all ave/correlate $s $p $d c_mySvx c_mySvy c_mySvz type auto file J0Jt.dat ave running
这样应该有问题吧？那么stress的维度该如何修改呢？
本人金币较少，真的不胜感激！
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1楼 2016-03-26 06:21:48
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Janetwx: 金币+4, ★有帮助 2016-03-27 02:08:46
lammps有一个green-kubo计算的例子。可以看到位力张量的分量是如何提取的。你研究的是什么体系？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Janetwx
2楼2016-03-27 00:38:17
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
Janetwx: 金币+3, ★有帮助 2016-03-27 02:11:42
在KAPPA那个文件夹内。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Janetwx
3楼2016-03-27 00:39:23
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Janetwx

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by brucefan at 2016-03-27 00:38:17
lammps有一个green-kubo计算的例子。可以看到位力张量的分量是如何提取的。你研究的是什么体系？

谢谢您！！我研究的就是水，目前想重复这篇paper的东西。
您说的是argon那个例子吗？里面貌似没有单独把virial，KE和PE对heat flux的contribution写出来的呀？
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  • 附件 1 : Characteristics_of_thermal_conductivity_in_classical_water_models.pdf
    • 2016-03-27 02:05:39, 1.24 M
4楼2016-03-27 02:06:32
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Janetwx

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by brucefan at 2016-03-27 00:39:23
在KAPPA那个文件夹内。

谢谢！那个文件下的in.heatflux貌似没有把heatflux分解呀？只能算KE,PE和Virial的总量吧？
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5楼2016-03-27 02:11:32
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