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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 有跨膜结构的蛋白但是没有预测到信号肽，怎么回事？
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kkxly

银虫 (小有名气)

[求助] 有跨膜结构的蛋白但是没有预测到信号肽，怎么回事？ 已有1人参与

有跨膜结构的蛋白但是没有预测到信号肽，怎么回事？

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i have a dream
1楼 2016-03-25 19:19:05
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anquren

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
预测方法的问题。
大部分跨膜蛋白是螺旋，少数跨膜区是折叠。你的跨膜结构是哪种？预测方法是什么？
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2楼2016-03-28 11:29:09
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kkxly

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by anquren at 2016-03-28 11:29:09
预测方法的问题。
大部分跨膜蛋白是螺旋，少数跨膜区是折叠。你的跨膜结构是哪种？预测方法是什么？

我用的是http://www.cbs.dtu.dk/cgi-bin/we ... 213&wait=20 这个网站预测的。
我刚开始得到了翻译了多肽预测不出信号肽，但是有跨膜结构。跟相近物种比对后，发现我的多肽在N端比其他物种多了一段序列。其他物种是有跨膜结构和信号肽的。当我把多余的那段序列去除了再预测，发现有信号肽。但是我的cDNA序列我认为测序没错啊，想不通。
有跨膜结构的蛋白但是没有预测到信号肽，怎么回事？
QQ图片20160328204528.png


有跨膜结构的蛋白但是没有预测到信号肽，怎么回事？-1
QQ图片20160328204704.png


有跨膜结构的蛋白但是没有预测到信号肽，怎么回事？-2
QQ图片20160328204710.png
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i have a dream
3楼2016-03-28 20:51:29
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千里鼠0609

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by kkxly at 2016-03-28 20:51:29
我用的是http://www.cbs.dtu.dk/cgi-bin/webface2.fcgi?jobid=56F923BF00003DE9675B7213&wait=20 这个网站预测的。
我刚开始得到了翻译了多肽预测不出信号肽，但是有跨膜结构。跟相近物种比对后，发现我的 ...

您好，我也遇到了这个问题，其他物种的同工酶有信号肽，可是我的序列预测不出来，想向您请教后来是怎样解决的
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4楼2018-12-29 15:55:25
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还在等我吗

新虫 (初入文坛)
你好，请问问题怎么解决的呀

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5楼2023-03-14 20:03:24
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