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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】freqchk工具的用法

gaussian 附带一些小工具,比如说freqchk工具,可以根据某一个温度下频率计算生成的chk文件,来快速的得到其他温度下的能量。
我现在有疑问就是,在运行freqchk工具的时候有个参数:
Scale factor for frequencies during thermochemistry? [0=>1/1.12]
对应着输出中的:
Thermochemistry will use frequencies scaled by 0.8929
这个参数可以默认此值,也可以不需要换算,两种情况,对于结果输出的能量值是不同的。
这个换算是什么意思?是不是根据你得到chk文件的那个输入文件中调用的方法和基组相对应?计算能量一般是用到很高级别的方法,我用的是组合算法,比如说G3MP2那么我的这个因子又应该怎么设置呢?
手册P206有说明,也没有看太明白,恳请高手答疑!
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

谢谢楼上的帮助,呵呵。
乐观、执着、勤奋
4楼2008-10-19 14:47:05
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
scale factor 是为了消除系统误差
一般计算考虑的是简谐正则振动,实际分子振动还要考虑非简谐正则振动,所以要乘上频率校正因子。
一般来说,不同的方法和基组有不同的校正因子,http://www.bsc.ustc.edu.cn/~dxl/gaussian/VFS.mht
在《Exploring Chemistry with Electronic Structures》频率计算那一章里P64,对于G2,zpe校正是0.8929,G3没有列出。这个得要查查文献看别人如何校正的了
悠悠天地,奈何独立苍茫?
2楼2008-10-19 14:03:02
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★
jghe(金币+2,VIP+0):谢谢你的帮助!
这个地方的scale factor介绍详细一些
http://cccbdb.nist.gov/default.htm
悠悠天地,奈何独立苍茫?
3楼2008-10-19 14:12:52
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bylin

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
对,这个换算是根据你得到chk文件的那个输入文件中调用的方法和基组相对应的。比如,如果你用的是HF/6-31G(d),那么scal=0.8929。如果你把scal设为了1,那么freqchk输出的就是你原始chk文件中未经scaled的Zero-point energy和Thermal correction to energy。

G2等复合方法包含多步能量计算,但主要是对电子能量的计算,频率计算(也就是能量热修正的计算)只在其中的一步进行,且那一步中输出的Zero-point energy和Thermal correction to energy都是未经scaled,到最后一步计算时才对它们进行scale并加到总能量中去,进行scale的scale factor也是根据频率计算的那一步方法确定的。

所以freqchk读G2等复合方法的chk文件时,如果把scal设为了1,输出的也是复合方法中频率计算那一步中输出的未经scaled的Zero-point energy和Thermal correction to energy,你必须把scal设为和复合方法中频率计算所用方法相应的scale factor才能得到正确结果。

举个例子说,如果你有了G2方法的298K的chk文件,但想知道443K的能量,那你就把298K的chk文件作为freqchk的输入文件,freqchk的输入参数中温度则设为443K,scale factor设为0.8929(因为G2中算频率的是HF/6-31G(d)).
5楼2008-10-20 22:06:10
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