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6309155

新虫 (小有名气)

[求助] 单点能计算

想知道怎样去计算包合物的变形能,看到了前辈写得贴,如下:

"1)先对各个结构进行定义:
单独优化A,得到的结构是A1,其能量为E(A1);单独优化B,得到的结构是B1,其能量为E(B1)。
优化复合物AB,得到的结构是X,对X进行BSSE校正后,得到其能量为E(X)。
(2)然后在结构X中,抽取原先属于A的那些原子(也就是将原先属于B的那些原子改成空原子Bq),计算单点能,得到E(A2);抽取原先属于B的那些原子(也就是将原先属于A的那些原子改成空原子Bq),计算单点能,得到E(B2)。"

想求教下下,“也就是将原先属于B的那些原子改成空原子Bq”这句话具体对应的操作?是把对应的包合物里面B部分原子全部删除么?
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