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6309155

新虫 (小有名气)

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[求助] 单点能计算

想知道怎样去计算包合物的变形能，看到了前辈写得贴，如下：

"1）先对各个结构进行定义：
单独优化A，得到的结构是A1，其能量为E(A1)；单独优化B，得到的结构是B1，其能量为E(B1)。
优化复合物AB，得到的结构是X，对X进行BSSE校正后，得到其能量为E(X)。
（2）然后在结构X中，抽取原先属于A的那些原子（也就是将原先属于B的那些原子改成空原子Bq），计算单点能，得到E(A2);抽取原先属于B的那些原子（也就是将原先属于A的那些原子改成空原子Bq），计算单点能，得到E(B2)。"

想求教下下，“也就是将原先属于B的那些原子改成空原子Bq”这句话具体对应的操作？是把对应的包合物里面B部分原子全部删除么？

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1楼 2016-03-20 15:56:15

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