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yaohonghao

金虫 (小有名气)

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专业: 材料物理化学

[求助] Invalid attribute in dump custom command问题求助已有1人参与

本人毕业设计做界面力学性能模拟，使用候怀宇和张新平老师编写的《材料科学与工程中的计算机应用》学习LAMMPS。
练习例5-3 Cu晶体拉伸过程的分子动力学模拟时，出现了Invalid attribute问题。查看了manual中dump命令没有发现问题。
如果把dump删了程序就出现Invalid Syntax in variable formula错误
求各位大神抽空帮个忙看看~~~
# ------------------------ INITIALIZATION ----------------------------
units metal
atom_style atomic
boundary p p p

# ----------------------- ATOM DEFINITION ----------------------------
variable a equal 3.615
lattice fcc $a
region mybox block 0 10 0 6 0 6
create_box 1 mybox
create_atoms 1 box

# ------------------------ FORCE FIELDS ------------------------------
pair_style eam
pair_coeff 1 1 Cu_u3.eam

# ------------------------- SETTINGS ---------------------------------

timestep 0.001
thermo 200
thermo_style custom step temp pe vol lx ly lz press
velocity all create 300 72437 dist gaussian
fix 1 all npt temp 300 300 0.5 iso 0 0 0.8 drag 1.0
run 3000
unfix 1
variable L equal lx
variable L0 equal $L
reset_timestep 0
fix npt all npt temp 300 300 0.5 y 0 0 0.8 z 0 0 0.8 drag 1.0

fix def  all deform 1 x erate 0.005 units box remap x

variable ss equal (lx-${L0}/)/${L0}
variable p1 equal v_ss
variable p11 equal -pxx
variable p22 equal -pyy
variable p33 equal -pzz

compute      p all pe/atom
compute cs all centro/atom fcc
compute s all stress/atom NULL

thermo 1000
thermo_style custom step temp v_ss v_p11 v_p22 v_p33 pe etotal lx press

dump 1 all cfg 200 cu * .cfg mass type xs ys zs id c_p c_cs c_s[1] c_s[2] c_s[3]
dump_modify 1 element Cu

fix pp all print 100 "${p1} ${p11} ${p22} ${p33}" file ex3_ss.txt screen no
run      200

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1楼 2016-03-20 14:32:22

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alundilong

木虫 (正式写手)

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注册: 2008-09-08
性别: GG
专业: 传热传质学

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

每个case运行都会产生日志文件log.lammps
打开log.lammps看看
看最后一行说啥

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