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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MS模拟中向模型中添加小分子的问题？求指导 谢谢了
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鬼斗1990

金虫 (小有名气)

[求助] MS模拟中向模型中添加小分子的问题？求指导 谢谢了 已有1人参与

我是做环氧树脂与固化剂交联之后向体系中添加小分子，然后通过均方位移计算小分子扩散系数的！有以下几个问题   求指导一下   真心急   先谢谢大家了！
我做双酚A型环氧树脂与IPD固化剂交联的，因为不会编程，所以，固化过程是自己手动交联的，
在交联完成之后，要想模型中添加双酚类有害物质，遇到以下问题：
1，我在添加是用的是adsorption locator这个功能，不知道是不是准确。前几次尝试，因为交联模型不是一条链，而是有长链、短链、还有单体，所以没有办法添加，后来把整个模型交联成一个链或几个长链之后，可以进行添加功能。（这一块求解释是为什么）
2，可以添加之后，出现了这样的困难，就是我的小分子添加不进去，尝试添加水分子，可以添加，但是添加双酚类物质  就出现以下错误   帮忙解答一下   谢谢了

MS模拟中向模型中添加小分子的问题？求指导  谢谢了
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MS模拟中向模型中添加小分子的问题？求指导  谢谢了-1
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1楼 2016-03-16 17:56:30
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鬼斗1990

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zyj8119 at 2016-03-17 14:28:43
手动估计也可以，但是如果聚合物分子太多，手动岂不是很累？
...

因为没有交联反应的程序，而我又不会编写语言，所以，只能手动了。我想问的是在添加小分子上该怎么操作，我错误的原因是什么，请指导一下。谢谢了
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6楼2016-03-17 16:35:26
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zyj8119

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
鬼斗1990: 金币+2, ★有帮助 2016-03-17 14:01:17
你是否有创腾的那个交联的perl源代码程序？
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好好学习，天天向上。
2楼2016-03-17 12:11:04
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鬼斗1990

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zyj8119 at 2016-03-17 12:11:04
你是否有创腾的那个交联的perl源代码程序？

是的，我用的都是他们本身的带的东西，没有修改，因为我是一个新手，求帮忙   谢谢
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3楼2016-03-17 14:01:09
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鬼斗1990

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zyj8119 at 2016-03-17 12:11:04
你是否有创腾的那个交联的perl源代码程序？

这个没有，我的交联过程是自己手动交联的，之前也提过关于交联的问题，但是，有些大神告诉我手动交联也是可以的！没有他们的交联的程序就没办法进行其他的操作吗？不应该啊
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4楼2016-03-17 14:04:47
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