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兰子兔

铁虫 (初入文坛)

[求助] 求大神帮我看看这两个序列是否一致? 已有2人参与

这是我在NCBI上对比的结果~

求大神帮我看看这两个序列是否一致?
2016-03-16.png
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1楼 2016-03-16 13:37:34
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hazenotfog

铜虫 (正式写手)
no definition是什么鬼，一致性是100％，登陆号看起来不对劲，楼主是不是操作步骤不对~

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2楼2016-03-16 13:44:24
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hazenotfog

铜虫 (正式写手)
要是操作木有问题，我猜，数据库里面用来比对的那个序列比你的序列长一点，因为覆盖率是94％，又因为一致性是100％，所以正好包含你的序列

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3楼2016-03-16 13:56:11
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兰子兔

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hazenotfog at 2016-03-16 13:56:11
要是操作木有问题，我猜，数据库里面用来比对的那个序列比你的序列长一点，因为覆盖率是94％，又因为一致性是100％，所以正好包含你的序列

我是菜鸟~不懂怎么弄，我就是把tair上的基因包括UTR都复制黏贴过去了~一条染色体上的两个基因，它们好像有相似性，我就比了下，但是看不懂！！
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4楼2016-03-16 13:59:01
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yueli7

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你这两条序列应该是一致的。hazenotfog的回答是对的。你的操作完全正确。1587个碱基匹配上，只不过两条在匹配过程中，一条序列占另外一条序列的94%。这94%是完完全全配上（100%）这样你理解吗？没有gap，不过匹配的方向是plus/minus。不是plus/plus。


希望可以帮到你。

这个结果说明这两条序列是一致的。
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5楼2016-03-16 19:04:53
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兰子兔

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by yueli7 at 2016-03-16 19:04:53
你这两条序列应该是一致的。hazenotfog的回答是对的。你的操作完全正确。1587个碱基匹配上，只不过两条在匹配过程中，一条序列占另外一条序列的94%。这94%是完完全全配上（100%）这样你理解吗？没有gap，不过匹配的 ...

谢谢你的回答，我能再请教你一个问题吗？就是最后一句，这个匹配方向会对这两条序列的一致性造成影响吗？这是我一年前做的一个东西，复试要用，所以我想翻出来。给我这个种子的师兄，告诉我，这两个是twins基因，我当时不太懂，现在必须弄明白了。我比对的时候是吧3‘UTR和5’UTR都算上去了的，这样有影响吗？
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6楼2016-03-16 22:45:39
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湖南戴鹏辉

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你可以将这两个基因的序列弄出来放到一个文本中，然后用DNAMAN进行比对
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好好生活，好好工作
7楼2016-03-17 16:42:16
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兰子兔

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 湖南戴鹏辉 at 2016-03-17 16:42:16
你可以将这两个基因的序列弄出来放到一个文本中，然后用DNAMAN进行比对

已经比对了，灰常感谢~
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8楼2016-03-17 18:35:50
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