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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 乳酸菌
汕头大学海洋科学接受调剂
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潇湘客

铜虫 (小有名气)

[求助] 乳酸菌 已有2人参与

大家好，我拿乳酸菌做的紫外诱变和化学诱变后筛出的耐酸菌株，拿去测16srRNA第一次的时候得到的序列NCBI中比对发现不是我的菌，但也是乳酸菌中的一种，后来划线后又去测比对出来又是我的菌株，我不放心拿去扩增了一个基因去测序也没问题，我以为这样应该就没问题了，哪知道后来在此基础上划线后去测又跟第一次的结果一样，天啊我到底该肿么办？还能相信16s吗？求大神指导…………
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1楼 2016-03-15 21:52:05
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二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1.可能你的菌是两种乳酸菌的混合，“我不放心拿去扩增了一个基因去测序也没问题”这一步感觉没必要，因为你选的可能是两个菌共有的基因。
2.16S鉴定本身是有局限性的，随着已知物种的逐渐增多，16S的分辨率就不够了。

建议测个基因组，一方面可确认物种，一方面也可判断是否为混合物种，具体可咨询
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2楼2016-06-14 15:28:00
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萌虫吃萌鸟

新虫 (小有名气)
如果你的菌不纯，就能解释这个现象了

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3楼2016-07-04 15:19:11
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ls2046

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

16s没有问题，只能说明你的菌种不纯，建议做单菌落纯种划线分离，分离几次以后挑选若干做16s鉴定，当然分离过程中也可能把你原来的菌给分离去除了，这个就需要多做几个了。这种情况，也有运气成分。祝顺利！
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一品黄山
4楼2016-07-05 09:56:41
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zd0311

新虫 (初入文坛)
做phes 基因吧

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gogogo
5楼2016-07-05 14:11:54
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