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xalixp

银虫 (小有名气)

[交流] 怎么设计团簇初始构型?

怎么设计团簇初始构型?特别是随着原子个数的增加,怎么对团簇进行初始构型,是不是在一定范围内原子进行空间随机分布?
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orion416

银虫 (小有名气)

同问,这个问题我也很想知道
2楼2008-10-17 09:01:24
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主

★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
那讲究大了
如果用第一性原理做 随机散点不可取
跑到平衡位置遥遥无期 甚至会出错
建议用MD跑
不同原子数取的优化结构不一样
文献已经非常之多 先去了解一下别人做到什么程度了吧
3楼2008-10-17 10:51:18
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wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
先在hyper等软件里做出大体构型,然后选择Molecualr Mechanics优化初始构型,然后选择Semi emprical再优化一下构型,这样得到的初始构型就可以用于进一步的优化处理了
悠悠天地,奈何独立苍茫?
4楼2008-10-17 11:16:18
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xalixp

银虫 (小有名气)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
在hyper等软件里做出大体构型 这构型也非常多呀!
5楼2008-10-17 23:09:37
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rcliutao

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by xalixp at 2008-10-16 22:50:
怎么设计团簇初始构型?特别是随着原子个数的增加,怎么对团簇进行初始构型,是不是在一定范围内原子进行空间随机分布?

你这个问题解决了没
6楼2008-11-12 11:29:28
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piao2004ha

铁虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我现在也遇到这个问题了.要是哪个哥们知道的话告诉一声.QQ:545143515
7楼2009-09-21 15:08:47
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lwei7336

木虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
loovfnd(金币+2,VIP+0):谢谢参与! 9-22 09:47
yjcmwgk(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版! 9-22 09:48
我研究过渡金属团簇时,13个原子以下,都是用gaussview自己一个个搭建的,构型主要来自文献
几十个原子的,上百的团簇,用ms先构建出晶体,再根据需要切削。一般切成立方八面体,八面体也就够了
8楼2009-09-22 09:44:16
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zhangfan2192

金虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 9-22 14:04
20个以内的 见很多用遗传算法 ,原子比较多的 感觉还是MD 比较好点
相逢是缘!
9楼2009-09-22 10:28:02
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