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[交流]
【求助】如何在计算机集群上做并行计算
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有专门用来做高斯计算的集群，24个节点，Linux系统。但管理机器的人不知道怎么做并行计算，求助做过的xd，用那个secureCRT登录主机，如何让比如5个节点同时计算？谢谢 [ Last edited by zzgyb on 2008-10-16 at 15:30 ] |
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8楼2008-10-17 08:47:29
richard58272
金虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 3520.9
- 散金: 50
- 红花: 3
- 帖子: 501
- 在线: 81.2小时
- 虫号: 498114
- 注册: 2008-02-03
- 性别: GG
- 专业: 化学信息学
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zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
| 建议你问一下专门做高斯或分子动力学的教授，我知道有一个，他自己管理机群，不过他不上小木虫。你可以给他发电子邮件：严六明，上海大学化学系教授，liuming.yan@shu.edu.cn。 |
2楼2008-10-16 16:20:39
abbott
金虫 (著名写手)
不要用QQ问我东西
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 1071.6
- 散金: 2787
- 红花: 10
- 帖子: 1015
- 在线: 105.2小时
- 虫号: 452267
- 注册: 2007-11-05
- 性别: GG
- 专业: 计算机硬件技术
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如果只做G03的并行的话，我可以帮你配置！ 我只提供最为简单的。 但是如果是多用户使用的话，需要别的服务配置！ 邮件abbott.cn@gmail.com 如果你有更好的解决办法，大家一起交流啊！ |
4楼2008-10-16 19:02:23
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我看了别人写的，输入以下： echo “Tsnet.Node.lindarsharg: ssh” >~/.tsnet.config export GAUSS_LFLAGS=‘ -nodelist “Node1 Node2”’ export GAUSS_EXEDIR=/home/gauss/g03/linda-exe:$GAUSS_EXEDIR gjf文件里把并行机器的个数和单个机器cpu个数标出： %nprocl=2 %nprocs=1 然后提交： g03 ××.gjf & 但只在一个节点上计算。 另外有个问题，用我们那集群的计算机算几个小时，有时算几分钟，计算就自己停止了。log文件没有报错，也没显示已算完。这是咋回事？ |
5楼2008-10-16 20:32:43