24小时热门版块排行榜    

查看: 2701  |  回复: 7

sin81

金虫 (正式写手)

[求助] vasp 并行安装时openmpi出现错误 已有4人参与

安装openmpi时候,用:./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort
make, make install后,能正常结束,但到example里make时候,就出现下面错误:

mpicc -g    hello_c.c   -o hello_c
--------------------------------------------------------------------------
The Open MPI wrapper compiler was unable to find the specified compiler
pgcc in your PATH.

Note that this compiler was either specified at configure time or in
one of several possible environment variables.
--------------------------------------------------------------------------
make: *** [hello_c] Error 1


如果  ./configure 后面不加那些东西,就没问题,mpirun -np 8 hello_c 也能正常显示,但vasp编译时候,到了mpi地方就出错。
很困惑,请高手指点。

用的是fftw-3.3.4 ,intel_intel_fortran_xe_2013, openmpi.1.10 (1.4版本也是这样)。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

obaica

禁言 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

2楼2016-03-13 21:27:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sin81

金虫 (正式写手)

这个加过,不加他安装到默认地址,但加跟不加结果一样

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2016-03-13 23:35:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

迷路的游侠

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先vasp编译用不到openmpi,fftw-3.3.4 ,intel_intel_fortran_xe_2013就够了。你要用openmpi的话编译完要在环境变量里定义好。先看看which mpicc是哪个编译器的。置于你说的mpirun正常是因为ifort也有mpirun,openmpi也有mpirun命令,你要搞清楚你用的到底是啥
4楼2016-03-15 09:32:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ireson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
openmpi安装的时候不需要限定这么多条件,FC=ifort就可以了。F77在新的openmpi里好像没有了,用./configure  --help看看,有的话就让它等于ifort。其次,用openmpi安装vasp当然没问题。不过我用16版的intel编译器没装成功过VASP,openmpi倒是没问题;用13版的就都成功了,感觉我这个问题是编译的锅。我的这个经验可能对你有用

发自小木虫Android客户端
5楼2016-03-15 21:10:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sin81

金虫 (正式写手)

谢谢,补充一下,我现在用的是2015版的intel编译器,目前能成功编程出vasp(5.3版本),但运行有误,
显示:forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000000D5EF71  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000D5D6C7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000CEEF74  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000CEED86  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000C9B40F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000CA13CD  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread.so.0    00002AB1D7336130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000B6F110  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000B3E42D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000B3EECE  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000B3EA32  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000053E757  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000054413B  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000431F7B  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000040EA8E  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00002AB1D81F9AF5  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000040E999  Unknown               Unknown  Unknown


用openmpi编译也是同样的问题,加或不加 -heap-arrays 64,都不行,设置OFLAG=-O1, 或O2都不行。

请高手指教。谢谢!
6楼2016-03-16 09:43:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

最好把Makefile放上来
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
7楼2016-03-17 10:28:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sin81

金虫 (正式写手)

为什么贴makefile会被屏蔽掉???
8楼2016-03-17 12:57:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sin81 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +4 瞬息宇宙 2026-08-10 4/200 2026-08-11 02:02 by 旁观2020
[基金申请] 帮忙看看fileCode +4 wwncly 2026-08-10 8/400 2026-08-10 22:07 by demonstreets
[基金申请] filecode +8 documentary 2026-08-10 8/400 2026-08-10 19:20 by loufangrui
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +10 yufeiwaner 2026-08-09 11/550 2026-08-10 18:47 by yufeiwaner
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +4 布布和一二 2026-08-10 4/200 2026-08-10 14:50 by 医学老男孩
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +11 archvillain 2026-08-04 13/650 2026-08-10 14:41 by seekfind
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
信息提示
请填处理意见