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sin81

金虫 (正式写手)

[求助] vasp 并行安装时openmpi出现错误 已有4人参与

安装openmpi时候,用:./configure CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort
make, make install后,能正常结束,但到example里make时候,就出现下面错误:

mpicc -g    hello_c.c   -o hello_c
--------------------------------------------------------------------------
The Open MPI wrapper compiler was unable to find the specified compiler
pgcc in your PATH.

Note that this compiler was either specified at configure time or in
one of several possible environment variables.
--------------------------------------------------------------------------
make: *** [hello_c] Error 1


如果  ./configure 后面不加那些东西,就没问题,mpirun -np 8 hello_c 也能正常显示,但vasp编译时候,到了mpi地方就出错。
很困惑,请高手指点。

用的是fftw-3.3.4 ,intel_intel_fortran_xe_2013, openmpi.1.10 (1.4版本也是这样)。
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obaica

禁言 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

2楼2016-03-13 21:27:19
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sin81

金虫 (正式写手)

这个加过,不加他安装到默认地址,但加跟不加结果一样

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2016-03-13 23:35:41
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迷路的游侠

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先vasp编译用不到openmpi,fftw-3.3.4 ,intel_intel_fortran_xe_2013就够了。你要用openmpi的话编译完要在环境变量里定义好。先看看which mpicc是哪个编译器的。置于你说的mpirun正常是因为ifort也有mpirun,openmpi也有mpirun命令,你要搞清楚你用的到底是啥
4楼2016-03-15 09:32:02
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Ireson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
openmpi安装的时候不需要限定这么多条件,FC=ifort就可以了。F77在新的openmpi里好像没有了,用./configure  --help看看,有的话就让它等于ifort。其次,用openmpi安装vasp当然没问题。不过我用16版的intel编译器没装成功过VASP,openmpi倒是没问题;用13版的就都成功了,感觉我这个问题是编译的锅。我的这个经验可能对你有用

发自小木虫Android客户端
5楼2016-03-15 21:10:12
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sin81

金虫 (正式写手)

谢谢,补充一下,我现在用的是2015版的intel编译器,目前能成功编程出vasp(5.3版本),但运行有误,
显示:forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
vasp               0000000000D5EF71  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000D5D6C7  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000CEEF74  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000CEED86  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000C9B40F  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000CA13CD  Unknown               Unknown  Unknown
libpthread.so.0    00002AB1D7336130  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000B6F110  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000B3E42D  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000B3EECE  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000B3EA32  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000053E757  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000054413B  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               0000000000431F7B  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000040EA8E  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          00002AB1D81F9AF5  Unknown               Unknown  Unknown
vasp               000000000040E999  Unknown               Unknown  Unknown


用openmpi编译也是同样的问题,加或不加 -heap-arrays 64,都不行,设置OFLAG=-O1, 或O2都不行。

请高手指教。谢谢!
6楼2016-03-16 09:43:58
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

最好把Makefile放上来
我们最深的恐惧不是我们能力不够,我们最深的恐惧是能力超越了极限。
7楼2016-03-17 10:28:04
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sin81

金虫 (正式写手)

为什么贴makefile会被屏蔽掉???
8楼2016-03-17 12:57:50
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