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徐雪菲

金虫 (正式写手)

[求助] 求下面结构中的拓扑标号

如题

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wangningsir

木虫 (著名写手)

上书房行走

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
徐雪菲: 金币+10, 博学EPI+1 2016-03-12 21:28:08
##################
1:X74-80 in P-1 #2
##################

Topology for Zn1
--------------------
Atom Zn1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)
Zn 1    0.5739    0.3399    0.4970   ( 1 1 1)     3.567A        1
Zn 1    1.4261    1.6601    0.5030   ( 1 1 0)     9.660A        1
Zn 1   -0.5739   -0.3399    0.5030   (-1-1 0)     9.660A        1
Zn 1    0.5739    1.3399    1.4970   ( 1 2 2)    11.210A        1
Zn 1    0.5739    0.3399   -0.5030   ( 1 1 0)    11.339A        1
-------------------------
Structural group analysis
-------------------------

-------------------------
Structural group No 1
-------------------------
Structure consists of 3D framework with Zn

Coordination sequences
----------------------
Zn1:  1  2  3  4   5   6   7   8   9   10
Num   5 14 29 50  77 110 149 194 245  302
Cum   6 20 49 99 176 286 435 629 874 1176
----------------------
TD10=1176

Vertex symbols for selected sublattice
--------------------------------------
Zn1 Point symbol:{4^6.6^4}
Extended point symbol:[4.4.4.4.4.4.6(3).6(3).6(3).6(3)]
--------------------------------------
Point symbol for net: {4^6.6^4}
5-c net; uninodal net

Topological type: bnn hexagonal BN; 5/4/h5; sqc12 (topos&RCSR.ttd) {4^6.6^4} - VS [4.4.4.4.4.4.6.6.6.*] (16813 types in 3 databases)
Elapsed time: 14.36 sec.

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  • 附件 1 : top_analysis.docx
  • 2016-03-12 11:07:35, 57.38 K
文艺青年researchid: http://www.researcherid.com/rid/G-7891-2011
2楼2016-03-12 11:07:37
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普通回帖

徐雪菲

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-12 11:07:37
##################
1:X74-80 in P-1 #2
##################

Topology for Zn1
--------------------
Atom Zn1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A ...

我的结构是二维的,为什么分析出来是三维的啊?理论上Zn是三连接,配体是四连接,求大神的再次帮助。
3楼2016-03-12 21:27:56
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wangningsir

木虫 (著名写手)

上书房行走

确定是二维的?我在mercury里看是三维的,我再按二维给你弄下,自己选择

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文艺青年researchid: http://www.researcherid.com/rid/G-7891-2011
4楼2016-03-12 21:35:29
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wangningsir

木虫 (著名写手)

上书房行走

【答案】应助回帖

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  • 附件 1 : 2d.docx
  • 2016-03-12 22:39:24, 36.77 K
  • 附件 2 : 3d.docx
  • 2016-03-12 22:39:34, 78.25 K
文艺青年researchid: http://www.researcherid.com/rid/G-7891-2011
5楼2016-03-12 22:42:10
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徐雪菲

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-12 21:35:29
确定是二维的?我在mercury里看是三维的,我再按二维给你弄下,自己选择

我是在0lex2中解的单晶,mercury里面的键长没限制,可能会长成三维的,确实是二维的,锌是四配位,有一个是水分子,一个配体是线性的,还有一个是四羧酸配体。
6楼2016-03-13 13:36:19
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wangningsir

木虫 (著名写手)

上书房行走

最好先用diamondx画下,然后把diamond文件发我

发自小木虫Android客户端
文艺青年researchid: http://www.researcherid.com/rid/G-7891-2011
7楼2016-03-13 13:39:21
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徐雪菲

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-12 21:35:29
确定是二维的?我在mercury里看是三维的,我再按二维给你弄下,自己选择

一个配体连了四个金属,应该简化为四节点。金属简化为三节点就可以了,但是我对拓扑不是很熟悉,简化不出来。你能不能按照这个简化一下啊,拜托了。
8楼2016-03-13 13:39:44
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徐雪菲

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wangningsir at 2016-03-13 13:39:21
最好先用diamondx画下,然后把diamond文件发我

我把diamond发给你
9楼2016-03-13 13:40:58
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徐雪菲

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 徐雪菲 at 2016-03-13 13:40:58
我把diamond发给你...

这是dimond

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  • 附件 1 : X74-801.DSF
  • 2016-03-13 13:45:13, 71.33 K
  • 附件 2 : X74-80节点简化.DSF
  • 2016-03-13 13:45:27, 14.54 K
10楼2016-03-13 13:45:47
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