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漫洒特

木虫 (小有名气)

[求助] 富锂三元材料Li1.2Mn0.54Ni0.13Co0.13O2的层状结构用MS软件如何画出?已有1人参与

敬请高手指点,想做富锂三元材料的结构设计去预测其性能,看到文献上人家画的三元材料的层状结构,他们是用什么软件画的?我用MS软件能画吗?具体如何画啊?
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漫洒特

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小红豆 at 2016-03-10 16:44:57
第一种情况: 从程序自带的各种晶体及有机模型中导入体系的晶胞
1. 打开MS,由file>import>structures>metals\>pure-metals>Fe导入Fe的晶胞。
2. 由build>Surfaces>cleave Surfaces打开对话 ...

太感谢啦,我是初学者,没有接触过计算化学,提到计算恐怖加迷茫,谢谢您的回复,有问题继续向您请教!
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3楼2016-03-11 11:39:25
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小红豆

主管区长 (知名作家)

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【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
漫洒特: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2016-03-11 11:37:13
第一种情况: 从程序自带的各种晶体及有机模型中导入体系的晶胞
1. 打开MS,由file>import>structures>metals\>pure-metals>Fe导入Fe的晶胞。
2. 由build>Surfaces>cleave Surfaces打开对话框.
    在对话框中输入要建立的晶面(hkl),选择position,其中depth控制晶面层数。
3. 进入build>Supercell,输入A 、B 、C的值,得到想要的超晶胞。
4. 到该步骤,我们已经建立了一个周期性的超晶胞。如果要做周期性计算,则应选择build>Crystals>build vaccum slab,其中真空层通常选择10埃以上。如果建立团簇模型则选择build>Symmetry>Non-periodic Structure,去掉模型的周期性,并跟据自己的实际需要删除部分原子,得到想要的团簇模型。
5. 在表面插入分子时通过菜单栏上的几个小图标添加即可。

第二种情况: 手动建模,优点是可控制晶格常数。
6. 首先从文献中查到晶体的晶格常数的实验值。
7. 打开build>Crystals>build crystals,可见到对话框。
     在对话框中选择空间群与点群,然后在Lattice Parameter中设置晶胞基矢的长度及夹角。
8. 然后打开build>Add atom,从对话框中输入坐标。这里只需输入几个有代表性的原子的坐标,不必全部输入。在坐标输入前首先在option页面中选择coordinate system,或者分数坐标或者卡迪尔坐标。
9. 以下步骤重复2-5步。
10. 需要注意的是,采取什么样的团簇并不是任意的。原因是很多模型构造出来后在优化过程中往往不收敛。要避免这个问题的办法是查阅文献,参考文献上模型进行选取,因为它们的模型通常是经过试验证实收敛的。
2楼2016-03-10 16:44:57
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