24小时热门版块排行榜    

查看: 841  |  回复: 17
当前主题已经存档。

sxllgaoli898

金虫 (小有名气)

[交流] 求助:溶剂化问题

各位高手,在计算溶剂化时,输出文件中:
Variational C-PCM results
=========================
                     (a.u.) =    -446.879626
                     (a.u.) =    -447.001680
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms            (a.u.) =    -446.994755
我想问一下:Total free energy in solution上面两行的能量指的是什么?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
=========================
                     (a.u.) =    -446.879626  (气相中的SCF能量)
                     (a.u.) =    -447.001680 (液相中的SCF能量)
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms            (a.u.) =    -446.994755  (液相中的总能量)
悠悠天地,奈何独立苍茫?
2楼2008-10-16 18:44:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoboy185

金虫 (正式写手)

想请教一下 后面两种有什么区别
3楼2008-10-16 18:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

elexware

银虫 (小有名气)

请问wxjbuilder  :溶剂化能=气相中的SCF能量-液相中的SCF能量?还是,表示什么样的趋势,溶剂话能愈大,溶质与溶剂的作用愈大?
其实一切都还好...
4楼2008-10-17 08:23:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
sxllgaoli898(金币+5,VIP+0):解释的很清楚,谢谢了
zzgyb(金币+4,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
引用回帖:
Originally posted by xiaoboy185 at 2008-10-16 18:58:
想请教一下 后面两种有什么区别

Variational PCM results
=======================
                 (a.u.) =    -382.269303    (气相中的SCF能量)
                  (a.u.) =    -382.281309    (液相中的SCF能量)
Total free energy in solution:
  with all non electrostatic terms           (a.u.) =    -382.267888       (液相中的总能量)
--------------------------------------------------------------------
(Polarized solute)-Solvent               (kcal/mol) =      -7.53      (静电能)
--------------------------------------------------------------------
Cavitation energy                        (kcal/mol) =      17.78    (空穴能)
Dispersion energy                        (kcal/mol) =      -9.88    (色散能)
Repulsion energy                         (kcal/mol) =       0.52   (排斥能)
Total non electrostatic                     (kcal/mol) =       8.42   (总的非静电能项)
--------------------------------------------------------------------
液相中的总能量是SCF能量与总的非静电能项之和。即 -382.267888 au=-382.281309 au + 8.42kcal/mol

[ Last edited by wxjbuilder on 2008-10-17 at 11:30 ]
悠悠天地,奈何独立苍茫?
5楼2008-10-17 11:25:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):溶剂化能=液相中的SCF能量-气相中的SCF能量,溶剂化能是负值。
引用回帖:
Originally posted by elexware at 2008-10-17 08:23:
请问wxjbuilder  :溶剂化能=气相中的SCF能量-液相中的SCF能量?还是,表示什么样的趋势,溶剂话能愈大,溶质与溶剂的作用愈大?

溶剂化能=液相中的SCF能量-气相中的SCF能量,溶剂化能是负值。
对于在气相与液相中构型变化较大的体系来说,要分别优化气相与液相中的构型,然后取两个能量的差值即溶剂化能。
对于在气相与液相中构型变化不大的分子来说,一般也可以这样处理,即在溶液中优化的结构直接在气相中算单点能,然后取两者之差;当然,也可以在气相中优化结构,在溶液中算能量,取两者的差值。
溶剂化能越大,个人认为溶剂与溶液之间的作用比较明显,因为这个时候气相和液相的构型相差比较大。
自己的一家之言,还请高手进行指正。
悠悠天地,奈何独立苍茫?
6楼2008-10-17 12:12:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sxllgaoli898

金虫 (小有名气)

谢谢楼上的解答,祝你好运!
7楼2008-10-17 14:58:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoboy185

金虫 (正式写手)

还想请问一下,如果我想知道某分子在溶剂中的能量,那么我应该选择液相中的SCF能量还是选择液相中的总能量??多谢!!!
8楼2008-10-17 15:41:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wxjbuilder

木虫 (知名作家)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):溶剂化能=液相中的SCF能量-气相中的SCF能量,溶剂化能是负值。
分子在溶剂中的能量?这要看你需要的是什么能量啊
我是这样理解的,分子在真空(气相)中的能量是SCF能量,那么分子在液相中的能量也是SCF能量,你说的是不是和气相相对应的能量?
SCF能量指的是电子的能量和核排斥能
悠悠天地,奈何独立苍茫?
9楼2008-10-17 19:00:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoboy185

金虫 (正式写手)

那么正常来说,我们在将一个反应放到溶剂中进行的时候,最后要画出这个反应在溶剂中进行时的势能面,这个时候我们应该取得是液相中的SCF能量还是选择液相中的总能量??
10楼2008-10-17 22:23:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sxllgaoli898 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见