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kevinrowe

金虫 (著名写手)

[求助] 分析质谱数据的MetAlign软件有会用的吗? 已有2人参与

如题,求助啊,捣鼓好久了,做出来的数据怎么都觉得不太对。参数太多,要怎么设啊?求大神。

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dnp

荣誉版主 (知名作家)

小木虫浪子

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kevinrowe: 金币+1, 有帮助 2016-03-09 16:53:37
kevinrowe: 金币+2, 有帮助 2016-03-11 15:46:07
看需要来吧,另外都多看文献,那些参数是设置用来预处理质谱数据的,而且对结果的影响很大,没有固定的理论来参考,只有自己一个一个慢慢试,在里面找经验,之后熟了就好办了。
What would Jesus do?
2楼2016-03-09 14:04:30
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dnp

荣誉版主 (知名作家)

小木虫浪子

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by kevinrowe at 2016-03-09 16:57:47
请问,红圈里面的参数怎么设?是每针样本运行时间吗?我是100min,“scan nr”是扫面次数的意思吗?那数值是用分钟数乘以每分钟的扫描次数吗?

MetAlign界面参数.PNG
...

http://www.mdpi.com/toc/htmlview ... 1424-8220/10/8/7122
我猜应该是扫描开始的时间和扫描结束的时间,也就是选一段色谱数据(在你设置的retention begin 和retention end之间)进行背景扣除和噪音消除,如果要进行全谱处理,应该是0到扫描点总数。
What would Jesus do?
4楼2016-03-11 14:25:51
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奔跑的萝卜丝

银虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kevinrowe: 金币+17, ★★★很有帮助 2016-06-28 22:56:39
引用回帖:
1楼: Originally posted by kevinrowe at 2016-03-07 20:56:06
如题,求助啊,捣鼓好久了,做出来的数据怎么都觉得不太对。参数太多,要怎么设啊?求大神。

这个软件主要是分辨率,峰移,峰宽,半峰宽,信噪比,其他的可以先用默认值先试一下,慢慢摸索吧。

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7楼2016-06-28 22:47:46
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普通回帖

kevinrowe

金虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dnp at 2016-03-09 14:04:30
看需要来吧,另外都多看文献,那些参数是设置用来预处理质谱数据的,而且对结果的影响很大,没有固定的理论来参考,只有自己一个一个慢慢试,在里面找经验,之后熟了就好办了。

请问,红圈里面的参数怎么设?是每针样本运行时间吗?我是100min,“scan nr”是扫面次数的意思吗?那数值是用分钟数乘以每分钟的扫描次数吗?
分析质谱数据的MetAlign软件有会用的吗?
MetAlign界面参数.PNG

3楼2016-03-09 16:57:47
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kevinrowe

金虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dnp at 2016-03-11 14:25:51
http://www.mdpi.com/toc/htmlview/tableview?i=t1-sensors-10-07122&m=sensors-10-07122-manuscript&v=t&u=/1424-8220/10/8/7122
我猜应该是扫描开始的时间和扫描结束的时间,也就是选一段色谱数据( ...

感谢,再研究研究。有问题再向您请教啊!
5楼2016-03-11 15:46:54
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kevinrowe

金虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dnp at 2016-03-11 14:25:51
http://www.mdpi.com/toc/htmlview/tableview?i=t1-sensors-10-07122&m=sensors-10-07122-manuscript&v=t&u=/1424-8220/10/8/7122
我猜应该是扫描开始的时间和扫描结束的时间,也就是选一段色谱数据( ...

再向您讨教个问题,第一张图是导出结果图。数据点是不是过于密集了啊?是不是峰阈值舍得低了?第二、第三张图是参数设置。请您帮着分析分析啊!
分析质谱数据的MetAlign软件有会用的吗?-1
20160206-display.PNG


分析质谱数据的MetAlign软件有会用的吗?-2
条件设置1.PNG


分析质谱数据的MetAlign软件有会用的吗?-3
条件设置2.PNG

6楼2016-03-11 15:59:10
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陈狗狗888

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 奔跑的萝卜丝 at 2016-06-28 22:47:46
这个软件主要是分辨率,峰移,峰宽,半峰宽,信噪比,其他的可以先用默认值先试一下,慢慢摸索吧。
...

您好,请问你有这个软件的安装包吗?如果方便的话可以给我发一个吗?chenjie9922@163.com  谢谢您了!
8楼2017-12-10 23:19:55
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陈狗狗888

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by kevinrowe at 2016-03-09 16:57:47
请问,红圈里面的参数怎么设?是每针样本运行时间吗?我是100min,“scan nr”是扫面次数的意思吗?那数值是用分钟数乘以每分钟的扫描次数吗?

MetAlign界面参数.PNG
...

您好,请问你有这个软件的安装包吗?如果方便的话可以给我发一个吗?chenjie9922@163.com  谢谢您了!
9楼2017-12-10 23:21:01
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太古剑魂

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by kevinrowe at 2016-03-11 15:59:10
再向您讨教个问题,第一张图是导出结果图。数据点是不是过于密集了啊?是不是峰阈值舍得低了?第二、第三张图是参数设置。请您帮着分析分析啊!

20160206-display.PNG

条件设置1.PNG

条件设置2.PNG
...

你好,metalign出来的数据集包含好多同一物质的不同碎片峰,如何只保留物质基峰离子的信号呢?
10楼2018-01-25 05:01:55
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