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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 初学MS受阻，求助
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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qw7706885er

金虫 (小有名气)

[求助] 初学MS受阻，求助

想构建一个S1型甲烷水合物，看论文上说的是：S1型甲烷水合物单胞含有46个水分子,8个甲烷分子,先确定氧原子初始位置,氧原子初始位置来源于射线单晶衍射实验,其中晶格中的氢原子排列是无序的,符合Benal-Flower规则,使用简单点电荷势能模型控制水的相互作用
现在已经通过FindIt找到了氧原子的坐标 ，但不知道接下来该怎么做，应该用MS哪个模块完成
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1楼 2016-03-03 17:40:35
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匿名

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5楼2016-03-24 16:55:51
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匿名

本帖仅楼主可见
3楼2016-03-24 10:44:16
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qw7706885er

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by caopinqiang at 2016-03-24 10:44:16
楼主解决了吗

一个师兄告诉我将原子初始坐标都导进去就行，说是MS显示的问题，不影响MD模拟结果，，

发自小木虫Android客户端
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4楼2016-03-24 16:26:47
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吃土的人

新虫 (初入文坛)
楼主，你好。我将坐标都导进去之后发现一个碳连着十二个氢，一个氧连着四个氢，请问你是怎么解决的
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6楼2017-12-04 16:30:29
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