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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 氢键怎么设置
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sofia7821

铜虫 (小有名气)

[求助] 氢键怎么设置 已有4人参与

菜鸟有个问题请教
用B3LYP/6-31G（d,p) 计算时候，氢键应该怎么设置?
多谢！
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1楼 2016-03-02 06:22:56
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chinapuzhen

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
首先明确一下，像氢键这种弱相互作用，用b3lyp方法合适么？

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2楼2016-03-02 07:18:53
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不取俗名

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
建议用mo6系列的泛函会更好

发自小木虫Android客户端
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3楼2016-03-02 10:22:44
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zdm5821

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
量子化学好就业不

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2016-03-02 11:12:39
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
建议你好好找Sobreva的帖子看看。

密度泛函理论中，现有的泛函都过于局域化，无法处理中远距离的相互作用。目前有两大类思路，一类是用包含色散相互作用的数据来对泛函进行拟合，比如我国复旦大学许昕老师开发的X3LYP和美国明尼苏达大学赵Yan开发的M06系列；另一类在已有的泛函基础上增加色散修正，比如B3LYP-D3。请自己查阅文献选取合适的泛函。用DFT计算氢键相互作用，基组必须加弥散，也就是+号。
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5楼2016-03-03 12:20:21
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sofia7821

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by yongleli at 2016-03-03 12:20:21
建议你好好找Sobreva的帖子看看。

密度泛函理论中，现有的泛函都过于局域化，无法处理中远距离的相互作用。目前有两大类思路，一类是用包含色散相互作用的数据来对泛函进行拟合，比如我国复旦大学许昕老师开发的 ...

谢谢
不知有无经验 我加弥散后的checkpoint 文件直接高斯打不开？

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6楼2016-03-03 15:41:04
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yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by sofia7821 at 2016-03-03 15:41:04
谢谢
不知有无经验 我加弥散后的checkpoint 文件直接高斯打不开？
...

打不开应该是你把文件放在了包含中文名的路径下了吧。
或者没有正常结束。
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7楼2016-03-03 17:16:06
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sofia7821

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by yongleli at 2016-03-03 17:16:06
打不开应该是你把文件放在了包含中文名的路径下了吧。
或者没有正常结束。...

是的 没有正常结束 可是我试了两回 都非正常结束 ？有无经验？

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8楼2016-03-03 20:07:23
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yongleli

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by sofia7821 at 2016-03-03 20:07:23
是的 没有正常结束 可是我试了两回 都非正常结束 ？有无经验？
...

这就不清楚了。需要找你身边的熟人给看看。
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9楼2016-03-04 12:55:22
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